WBP4

WW domen-vezujući protein 4 je proteinkoji je kod ljudi kodiran genom WBP4.^[5][6]

WBP4
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 2DK1, 2JXW
Identifikatori
Aliasi	WBP4
Vanjski ID-jevi	OMIM: 604981 MGI: 109568 HomoloGene: 38287 GeneCards: WBP4
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 13 (čovjek)[1] Bend 13q14.11 Početak 41,061,509 bp[1] Kraj 41,084,006 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 14 (miš)[2] Bend 14|14 D3 Početak 79,697,377 bp[2] Kraj 79,718,960 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • vezivanje iona cinka • proline-rich region binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • vezivanje iona metala • nucleic acid binding Ćelijska komponenta • nuclear speck • spliceosomal complex • nukleoplazma • jedro • U2-type precatalytic spliceosome Biološki proces • mRNA cis splicing, via spliceosome • mRNA processing • Prerada RNK • mRNA splicing, via spliceosome Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	11193	22380
Ensembl	ENSG00000120688	ENSMUSG00000022023
UniProt	O75554	Q61048
RefSeq (mRNK)	NM_007187	NM_018765
RefSeq (bjelančevina)	NP_009118	NP_061235
Lokacija (UCSC)	Chr 13: 41.06 – 41.08 Mb	Chr 14: 79.7 – 79.72 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira domen WW, koji sadrži vezujući protein 4. WW domen predstavlja malu i kompaktnu koptastu strukturu koja stupa u interakciju s prolinom bogatim ligandima. Ovaj kodirani protein je općeniti splajsosomni protein koji može imati ulogu u unakrsnom premošćivanju U1 i U2 snRNP-ova u splajsosomnom kompleksu A.^[6]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 376 aminokiselina, a molekulska težina 42.507 Da.^[7].

10		20		30		40		50
MADYWKSQPK		KFCDYCKCWI		ADNRPSVEFH		ERGKNHKENV		AKRISEIKQK
SLDKAKEEEK		ASKEFAAMEA		AALKAYQEDL		KRLGLESEIL		EPSITPVTST
IPPTSTSNQQ		KEKKEKKKRK		KDPSKGRWVE		GITSEGYHYY		YDLISGASQW
EKPEGFQGDL		KKTAVKTVWV		EGLSEDGFTY		YYNTETGESR		WEKPDDFIPH
TSDLPSSKVN		ENSLGTLDES		KSSDSHSDSD		GEQEAEEGGV		STETEKPKIK
FKEKNKNSDG		GSDPETQKEK		SIQKQNSLGS		NEEKSKTLKK		SNPYGEWQEI
KQEVESHEEV		DLELPSTENE		YVSTSEADGG		GEPKVVFKEK		TVTSLGVMAD
GVAPVFKKRR		TENGKSRNLR		QRGDDQ

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin