ARGLU1

Argininom i glutamatom bogati protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ARGLU1, lociranom na poziciji13q33.3.^[5]

ARGLU1
Identifikatori
Aliasi	ARGLU1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 614046 MGI: 2442985 HomoloGene: 9960 GeneCards: ARGLU1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 13 (čovjek)[1] Bend 13q33.3 Početak 106,541,673 bp[1] Kraj 106,568,137 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 8 (miš)[2] Bend 8|8 A1.1 Početak 8,715,075 bp[2] Kraj 8,740,521 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • cadherin binding Ćelijska komponenta • mitohondrija • jedro • nukleoplazma Biološki proces • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	55082	234023
Ensembl	ENSG00000134884	ENSMUSG00000040459
UniProt	Q9NWB6	Q3UL36
RefSeq (mRNK)	NM_018011	NM_176849
RefSeq (bjelančevina)	NP_060481	NP_789819
Lokacija (UCSC)	Chr 13: 106.54 – 106.57 Mb	Chr 8: 8.72 – 8.74 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Proteinski proizvod ovog gena predložen je kao MED1-interakcijski protein potreban za estrogen-ovisnu transkripciju gena i rast ćelija raka dojke.^[6]

Gen ARGLU1 eksprimira najmanje tri različite izoforme prerade RNK – potpuno prerađena izoforma koja kodira protein, izoforma koja sadrži zadržani intron, u jedru i izoforma koja sadrži alternativni egzon koji cilja transkript za nonsens propadanje. Nadalje, ARGLU1 sadrži dugu, evolucijski visoko konzerviranu sekvencu poznatu kao ultrakonzervirani element (UCE) koja se nalazi unutar zadržnog introna i preklapa alternativni egzon.^[7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 273 aminokiseline, a molekulska težina 33.216 Da.^[8]

10		20		30		40		50
MGRSRSRSSS		RSKHTKSSKH		NKKRSRSRSR		SRDKERVRKR		SKSRESKRNR
RRESRSRSRS		TNTAVSRRER		DRERASSPPD		RIDIFGRTVS		KRSSLDEKQK
REEEEKKAEF		ERQRKIRQQE		IEEKLIEEET		ARRVEELVAK		RVEEELEKRK
DEIEREVLRR		VEEAKRIMEK		QLLEELERQR		QAELAAQKAR		EEEERAKREE
LERILEENNR		KIAEAQAKLA		EEQLRIVEEQ		RKIHEERMKL		EQERQRQQKE
EQKIILGKGK		SRPKLSFSLK		TQD

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija

Zhang et al. (2011) klonirano ljudsko ARGLU1. Izvedeni protein od 273 aminokiseline ima pozitivno nabijeni N-terminalni domen bogat argininom i negativno nabijen C-terminaln domen bogat glutamatom. Također ima nekoliko signala za jedarnu lokalizaciju. Imunohistohemijska analiza otkrila je da je ARGLU1 pretežno lokaliziran u jedru ćelija raka dojke MCF-7, gdje se kolokalizirao s podjedinicom kompleksa medijator-1 (MED1). Analiza baze podataka otkrila je ortologe ARGLU1 u rodu Drosophila i miševima, ali ne i u kvascu.^[9]

Funkcija gena

Kompleks medijator je veliki proteinski kompleks, koji prenosi signale od transkripcijskih aktivatora do RNK- polimeraze II i općeg mehanizma za transkripciju. Kompleksi posrednika koji uključuju MED1 komuniciraju s estrogenim receptorima (ER ili ESR1) i posreduju u funkcijama ovisnim o estrogenu. Koristeći masenu spektrometriju, Zhang et al (2011) otkrili su da je ARGLU1 bio u interakciji s MED1, ali ne i s drugim podjedinicama medijatora. Analize imunoprecipitacije i povlačenja proteina potvrdile su njihovu direktnu interakciju. Analiza mutacije otkrila je da je za interakciju potrebna C-terminalna regija MED1 i N-terminalna regija ARGLU1. Ektopiijska ekspresija samog ARGLU1 povećala je aktivnost reportera ovisnu o estrogenu u ćelijama MCF-7, a koekspresija MED1 s ARGLU1 dodatno je povećala aktivnost reportera ovisnu o estrogenu. RNK kratke ukosnice usmjerena protiv ARGLU1 oslabila je estrogeno ovisnu indukciju ER ciljnih gena. Analiza imunoprecipitacije hromatina pokazala je da su i ARGLU1 i MED1 regrutirani kao kompleks za promotore ER ciljnih gena. Nokdaun studije pokazale su da je ARGLU1 potreban i za ovisnost o sidrištu i o nezavisnom rastu ćelija MCF-7. Pretpostavili su da ARGLU1 može imati regulatornu ulogu preko interakcije s kompleksima posrednika MED1.^[9]

Magomedova et al. (2019) identificirali su evolucijski konzervirani gen ARGLU1 tokom pregleda za modulatore signalizacije glukokortikoida u CNS -u. Inhibicija ARGLU1 u neuronskim čelijama miša rezultirala je velikim promjenama u ekspresiji ili preradom drugih gena uključenih u neurogenezu. Nokaut kod zebrice uzrokovao je neurorazvoj i srčane greške, a homozigotnost za nokaut Arglu1 cijelog tijela bila je letalna za mišje embrione. Autori su zaključili da je ARGLU1 potreban za moduliranje bazne transkripcije i oreradu tokom embrionskog razvoja u neuronskim ćelijama.^[10]