ATF3

CAMP-ovisni transkripcijski faktor ATF-3 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ATF3 sa hromosoma 1.^[5]

ATF3
Identifikatori
Aliasi	ATF3
Vanjski ID-jevi	OMIM: 603148 MGI: 109384 HomoloGene: 1265 GeneCards: ATF3
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 1 (čovjek)[1] Bend 1q32.3 Početak 212,565,334 bp[1] Kraj 212,620,777 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 1 (miš)[2] Bend 1 H6|1 96.28 cM Početak 190,902,493 bp[2] Kraj 190,950,236 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • protein heterodimerization activity • vezivanje identičnih proteina • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • vezivanje sa DNK • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Ćelijska komponenta • Jedarce • nukleoplazma • CHOP-ATF3 complex • jedro Biološki proces • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • positive regulation of cell population proliferation • skeletal muscle cell differentiation • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to arsenic-containing substance • Glukoneogeneza • cellular response to amino acid starvation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of TRAIL-activated apoptotic signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • PERK-mediated unfolded protein response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • endoplasmic reticulum unfolded protein response • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	467	11910
Ensembl	ENSG00000162772	ENSMUSG00000026628
UniProt	P18847	Q60765
RefSeq (mRNK)	NM_001030287 NM_001040619 NM_001206484 NM_001206485 NM_001206486 NM_001206488 NM_001674 NM_004024	NM_007498
RefSeq (bjelančevina)	NP_001025458 NP_001035709 NP_001193413 NP_001193415 NP_001193417 NP_001665	NP_031524
Lokacija (UCSC)	Chr 1: 212.57 – 212.62 Mb	Chr 1: 190.9 – 190.95 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 181 aminokiselina, a molekulska težina 20.576 Da.^[6]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MMLQHPGQVS		ASEVSASAIV		PCLSPPGSLV		FEDFANLTPF		VKEELRFAIQ
NKHLCHRMSS		ALESVTVSDR		PLGVSITKAE		VAPEEDERKK		RRRERNKIAA
AKCRNKKKEK		TECLQKESEK		LESVNAELKA		QIEELKNEKQ		HLIYMLNLHR
PTCIVRAQNG		RTPEDERNLF		IQQIKEGTLQ		S

Funkcija

Aktivirajući transkripcijski faktor 3 je član porodice proteina transkripcijskih faktora aktivacije sisarakog/cAMP koji reaguje na elemente koji vezuju (CREB). Za ovaj gen pronađeno je više varijanti transkripta, koje kodiraju dvije različite izoforme. Duža izoformi potiskuje, a ne aktivira transkripciju sa promotora sa ATF veznim elementima. Kraćoj izoformi (deltaZip2) nedostaje leucinski zatvarač, motiv dimerizacije proteina i ne vezuje se za DNK, a stimulira transkripciju, pretpostavlja se, izdvajanjem inhibitornih kofaktora od promotora. Moguće je da alternativna prerada ATF3 gena može biti fiziološki važna u regulaciji ciljnih gena.^[7]

Klinički značaj

ATF-3 ie induciran fiziološkim stresom u različitim tkivima.^[8] Također je marker regeneracije nakon ozljede ganglijskih neurona dorzalnog korijena, jer ozlijeđeni regenerirajući neuroni aktiviraju ovaj transkripcijski faktor.^[9] Studije funkcionalne validacije pokazale su da ATF3 može promovirati regeneraciju perifernih neurona, ali nije sposoban promovirati regeneraciju neurona centralnog nervnog sistema.^[10]

Interakcije

Pokazalo se da je ATF3 u interakciji sa:

• C-junom,^[8][11][12]
• DDIT3^[8]
• D-Jun,^[13]
• P53,^[14][15] and
• SMAD3.^[16]