Protein Bloomovog sindroma

From Wikipedia, the free encyclopedia

Protein Bloomovog sindroma
Remove ads

Protein Bloomovog sindroma je protein koji je kod ljudi kodiran genom BLM sa hromosoma 15, koji nije eksprimiran u Bloomovom sindromu.[5]

Kratke činjenice BLM, Dostupne strukture ...

Genski proizvod Bloomovog sindroma povezan je sa RecQ podskupom DNK helikaze koji sadrži DExH kutiju i ima aktivnosti DNK stimulirane ATPaze i ATP-ovisne DNK helikaze. Mutacije koje uzrokuju Bloomov sindrom deletiraju ili mijenjaju motive helikaze i mogu onemogućiti aktivnost 3' → 5' helikaze. Normalni protein može djelovati na suzbijanje neodgovarajuće homologne rekombinacije.[6]

Remove ads

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 1.417 aminokiselina, a molekulska težina 159.000 Da.[5]

1020304050
MAAVPQNNLQEQLERHSARTLNNKLSLSKPKFSGFTFKKKTSSDNNVSVT
NVSVAKTPVLRNKDVNVTEDFSFSEPLPNTTNQQRVKDFFKNAPAGQETQ
RGGSKSLLPDFLQTPKEVVCTTQNTPTVKKSRDTALKKLEFSSSPDSLST
INDWDDMDDFDTSETSKSFVTPPQSHFVRVSTAQKSKKGKRNFFKAQLYT
TNTVKTDLPPPSSESEQIDLTEEQKDDSEWLSSDVICIDDGPIAEVHINE
DAQESDSLKTHLEDERDNSEKKKNLEEAELHSTEKVPCIEFDDDDYDTDF
VPPSPEEIISASSSSSKCLSTLKDLDTSDRKEDVLSTSKDLLSKPEKMSM
QELNPETSTDCDARQISLQQQLIHVMEHICKLIDTIPDDKLKLLDCGNEL
LQQRNIRRKLLTEVDFNKSDASLLGSLWRYRPDSLDGPMEGDSCPTGNSM
KELNFSHLPSNSVSPGDCLLTTTLGKTGFSATRKNLFERPLFNTHLQKSF
VSSNWAETPRLGKKNESSYFPGNVLTSTAVKDQNKHTASINDLERETQPS
YDIDNFDIDDFDDDDDWEDIMHNLAASKSSTAAYQPIKEGRPIKSVSERL
SSAKTDCLPVSSTAQNINFSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFP
HTKEMMKIFHKKFGLHNFRTNQLEAINAALLGEDCFILMPTGGGKSLCYQ
LPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLTSLDIPATYLTGDKTDSEATNIY
LQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKLLARFVIDEAHCV
SQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKILRP
QVFSMSFNRHNLKYYVLPKKPKKVAFDCLEWIRKHHPYDSGIIYCLSRRE
CDTMADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFG
MGIDKPDVRFVIHASLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTR
LKRLIMMEKDGNHHTRETHFNNLYSMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGF
NPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDDVKSIVRFVQEHSSSQGMRNI
KHVGPSGRFTMNMLVDIFLGSKSAKIQSGIFGKGSAYSRHNAERLFKKLI
LDKILDEDLYINANDQAIAYVMLGNKAQTVLNGNLKVDFMETENSSSVKK
QKALVAKVSQREEMVKKCLGELTEVCKSLGKVFGVHYFNIFNTVTLKKLA
ESLSSDPEVLLQIDGVTEDKLEKYGAEVISVLQKYSEWTSPAEDSSPGIS
LSSSRGPGRSAAEELDEEIPVSSHYFASKTRNERKRKKMPASQRSKRRKT
ASSGSKAKGGSATCRKISSKTKSSSIIGSSSASHTSQATSGANSKLGIMA
PPKPINRPFLKPSYAFS
Remove ads

Mejoza

Thumb
Model mejotske rekombinacije, iniciran prekidom ili prazninom dvostrukog lanca, nakon čega slijedi uparivanje s homolognim hromosomom i invazija lanca kako bi se pokrenuo proces rekombinacijske popravke. Popravka jaza može dovesti do krosing-overa (CO) ili nekrosinga (NCO) bočnih regija. Smatra se da se rekombinacija CO javlja pomoću modela dvostrukpg Hollidayevog spoja (DHJ), ilustrovanog na desnoj strani, iznad. Smatra se da se NCO rekombinanti javljaju prvenstveno po modelu udvajanja ovisnog o lancima od sinteze (SDSA), koji je ilustrovan lijevo, gore. Čini se da je većina događaja rekombinacije tipa SDSA.

Rekombinacija tokom mejoze je često inicirana prekidom dvostrukog lanca DNK (DSB). Tokom rekombinacije, dijelovi DNK na 5' krajevima prekida se odsijecaju u procesu koji se zove resekcija. U koraku invazije lanca koji slijedi, nadvišena 3' kraj slomljenog molekula DNK tada "napada" DNK homolognog hromosoma koji nije slomljen. Nakon invazije lanca, daljnji slijed događaja može pratiti bilo koji od dva glavna puta koji vode do krosingovera (CO) ili bez njega (NCO) rekombinanta (pogledajte Genetička rekombinacija i donji dio slike u ovom odjeljku).

Pupajući kvasac Saccharomyces cerevisiae kodira ortolog proteina Bloomovog sindroma (BLM) koji je označen kao Sgs1 (mali supresor rasta 1). Sgs1(BLM) je helikaza koja funkcionira popravkama homolognom rekombinacijom DSB-a. Čini se da je helikaza Sgs1(BLM) centralni regulator većine rekombinacijskih događaja koji se dešavaju tokom mejoza uS. cerevisiae.[7] Tokom normalne mejoze Sgs1(BLM) je odgovoran za usmjeravanje rekombinacije ka alternativnom formiranju ili ranih NCO-a ili Hollidayevih spona zglobnih molekula, pri čemu se potonji kasnije rješavaju kao COs.[7]

U biljci Arabidopsis thaliana, homolozi Sgs1(BLM) helikaze djeluju kao glavne barijere za mejotsko stvaranje CO.[8] Smatra se da ove helikaze istiskuju invazivni lanac, omogućavajući njegovo udvostručavanje s drugim 3'-prepustnim krajem DSB-a, što dovodi do formiranja NCO rekombinantnog procesa postupkom koji se naziva udvostručavanje lanca ovisno o sintezi (SDSA) (vidi Genetička rekombinacija i sliku na ovaj odeljak). Procjenjuje se da je samo oko 4% DSB-a popravljeno rekombinacijom CO,[9] Sequela-Arnaud et al.[8] sugerirajići da su brojevi CO ograničeni zbog dugoročnih troškova rekombinacije CO, odnosno razbijanja povoljnih genetičkih kombinacija alela stvorenih prošlim prirodnim odabiranjem.

Remove ads

Interakcije

Pokazalo se da protein Bloomovog sindroma reaguje sa:

Reference

Dopunska literatura

Vanjski linkovi

Loading related searches...

Wikiwand - on

Seamless Wikipedia browsing. On steroids.

Remove ads