CAB39L

Proteinoliki kalcij-vezujući protein 39 je protein koji je kod ljudi kodiran genom CAB39L.^[5]

CAB39L
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 3ZHP
Identifikatori
Aliasi	CAB39L
Vanjski ID-jevi	OMIM: 612175 MGI: 1914081 HomoloGene: 69422 GeneCards: CAB39L
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 13 (čovjek)[1] Bend 13q14.2 Početak 49,308,650 bp[1] Kraj 49,444,064 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 14 (miš)[2] Bend 14|14 C3 Početak 59,678,421 bp[2] Kraj 59,823,213 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • protein serine/threonine kinase activity Ćelijska komponenta • citosol • intracellular anatomical structure Biološki proces • GO:0072468 Transdukcija signala Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	81617	69008
Ensembl	ENSG00000102547	ENSMUSG00000021981
UniProt	Q9H9S4	Q9DB16
RefSeq (mRNK)	NM_001079670 NM_001287337 NM_001287338 NM_001287339 NM_030925	NM_026908 NM_001360591 NM_001360592 NM_001360593
RefSeq (bjelančevina)	NP_001073138 NP_001274266 NP_001274267 NP_001274268 NP_112187	NP_081184 NP_001347520 NP_001347521 NP_001347522
Lokacija (UCSC)	Chr 13: 49.31 – 49.44 Mb	Chr 14: 59.68 – 59.82 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Hartz (2008) locirala je gen CAB39L na poziciji q14.2 hromosoma 13, na osnovu poravnavanja sekvence CAB39L (GenBank AX105381) sa genomskom sekvencom (36.1).^[6]

Pretražujući baze podataka za sekvence slične MO25-alfa (CAB39), Boudeau et al. (2003) identificirali su CAB39L, koji su označili kao MO25-beta. Izvedeni protein sadrži 334 aminokiseline. Western blot analiza otkrila je ekspresiju MO25-beta u nekoliko tkiva miša i ćelijskih linija sisavra, uključujući ćelije bubrega ljudskog embriona.

Koristeći analizu koimunoprecipitacije, Boudeau et al. (2003) pokazali su da je MO25-beta u interakciji sa ekvimolarnim heterotrimernim proteinskim kompleksom sa serin/treonin kinazom LKB1 (STK11) i STRAD-alfa (LYK5) ili STRAD-beta (ALS2CR2). MO25-beta i STRAD-beta stabilizirani LKB1 u aktivnom kompleksu. Zaključili su da MO25-beta može funkcionirati kao komponenta kompleksa skele.^[7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 337 aminokiselina, a molekulska težina 39 088 Da.^[8].

10		20		30		40		50
MKKMPLFSKS		HKNPAEIVKI		LKDNLAILEK		QDKKTDKASE		EVSKSLQAMK
EILCGTNEKE		PPTEAVAQLA		QELYSSGLLV		TLIADLQLID		FEGKKDVTQI
FNNILRRQIG		TRSPTVEYIS		AHPHILFMLL		KGYEAPQIAL		RCGIMLRECI
RHEPLAKIIL		FSNQFRDFFK		YVELSTFDIA		SDAFATFKDL		LTRHKVLVAD
FLEQNYDTIF		EDYEKLLQSE		NYVTKRQSLK		LLGELILDRH		NFAIMTKYIS
KPENLKLMMN		LLRDKSPNIQ		FEAFHVFKVF		VASPHKTQPI		VEILLKNQPK
LIEFLSSFQK		ERTDDEQFAD		EKNYLIKQIR		DLKKTAP

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin