DGCR8

Podjedinica DGCR8 mikroprocesorskog kompleksa (kritična regija 8 DiGeorgeovog sindroma) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom DGCR8 sa hromosoma 22.^[4] Kod drugih životinja, posebno kod običnih modelnih organizama Drosophila melanogaster i Caenorhabditis elegans, protein je poznat kao Pasha (eng. kovanica od partner Drosha).^[5] To je obavezna komponenta puta RNK interferencija.

DGCR8
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 1X47, 2YT4, 3LE4, 5B16
Identifikatori
Aliasi	DGCR8
Vanjski ID-jevi	OMIM: 609030 MGI: 2151114 HomoloGene: 11223 GeneCards: DGCR8
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 22 (čovjek)[1] Bend 22q11.21 Početak 20,080,232 bp[1] Kraj 20,111,877 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • primary miRNA binding • ribonuclease III activity • double-stranded RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • heme binding • protein homodimerization activity • vezivanje iona metala • vezivanje sa RNK • vezivanje identičnih proteina Ćelijska komponenta • citoplazma • microprocessor complex • Jedarce • jedro • nukleoplazma • GO:0097483, GO:0097481 postsynaptic density Biološki proces • regulation of stem cell proliferation • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • RNA phosphodiester bond hydrolysis • GO:0061715 miRNA metabolic process Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	54487	94223
Ensembl	ENSG00000128191	ENSMUSG00000022718
UniProt	Q8WYQ5	Q9EQM6
RefSeq (mRNK)	NM_001190326 NM_022720	NM_033324
RefSeq (bjelančevina)	NP_001177255 NP_073557	NP_201581
Lokacija (UCSC)	Chr 22: 20.08 – 20.11 Mb	n/a
PubMed pretraga	[2]	[3]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 773 aminokiseline, а molekulska težina Da. 86 045^[6]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
METDESPSPL		PCGPAGEAVM		ESRARPFQAL		PREQSPPPPL		QTSSGAEVMD
VGSGGDGQSE		LPAEDPFNFY		GASLLSKGSF		SKGRLLIDPN		CSGHSPRTAR
HAPAVRKFSP		DLKLLKDVKI		SVSFTESCRS		KDRKVLYTGA		ERDVRAECGL
LLSPVSGDVH		ACPFGGSVGD		GVGIGGESAD		KKDEENELDQ		EKRVEYAVLD
ELEDFTDNLE		LDEEGAGGFT		AKAIVQRDRV		DEEALNFPYE		DDFDNDVDAL
LEEGLCAPKK		RRTEEKYGGD		SDHPSDGETS		VQPMMTKIKT		VLKSRGRPPT
EPLPDGWIMT		FHNSGVPVYL		HRESRVVTWS		RPYFLGTGSI		RKHDPPLSSI
PCLHYKKMKD		NEEREQSSDL		TPSGDVSPVK		PLSRSAELEF		PLDEPDSMGA
DPGPPDEKDP		LGAEAAPGAL		GQVKAKVEVC		KDESVDLEEF		RSYLEKRFDF
EQVTVKKFRT		WAERRQFNRE		MKRKQAESER		PILPANQKLI		TLSVQDAPTK
KEFVINPNGK		SEVCILHEYM		QRVLKVRPVY		NFFECENPSE		PFGASVTIDG
VTYGSGTASS		KKLAKNKAAR		ATLEILIPDF		VKQTSEEKPK		DSEELEYFNH
ISIEDSRVYE		LTSKAGLLSP		YQILHECLKR		NHGMGDTSIK		FEVVPGKNQK
SEYVMACGKH		TVRGWCKNKR		VGKQLASQKI		LQLLHPHVKN		WGSLLRMYGR
ESSKMVKQET		SDKSVIELQQ		YAKKNKPNLH		ILSKLQEEMK		RLAEEREETR
KKPKMSIVAS		AQPGGEPLCT		VDV

Funkcija

Podjedinica DGCR8 je nalazi se u ćelijskom jedru i potrebna je za preradu mikroRNK (miRNA). Veže se za drugu podjedinicu Drosha, enzima RNaza III da bi formirao mikroprocesorski kompleks koji cijepa primarni transkript poznat kao pri-miRNK na karakterističnoj strukturu matična petlja poznatoj kao pre-miRNK, koja se zatim dalje obrađuje u fragmente miRNK pomoću enzima Dicer. DGCR8 sadrži RNK-vezujući domen i smatra se da veže pri-miRNK, kako bi je stabilizirala za obradu pomoću Drosha.^[7]

DGCR8 je takođe potreban za neke tipove popravke DNK. Uklanjanje UV-indukovane DNK fotoprodukata, tokom transkripcije ekscizijskog popravka (TC-NER), spojenih nukleotidna što zavisi od JNK fosforilacije DGCR8 na serinu 153.^[8] Iako je poznato da DGCR8 funkcionira u biogenezi mikroRNK, ova aktivnost nije potrebna za uklanjanje fotoproizvoda uzrokovanih UV- zračenjem ovisno o DGCR8.^[8] Nukleotidni popravak ekscizijom također je potreban za popravak oksidativnog oštećenja DNK zbog na vodik-peroksida (H₂O₂), a osiromašene ćelije u DGCR8 osjetljive su na H₂O₂.^[8]