INTS6

Podjedinica 6 integratorskog kompleksa je protein koji je kod ljudi kodiran genom INTS6, koji je lociran na hromosomu 13, sekvenca 13q14.3, u rasponu bazbih parova od 51,354.077 do 51,454.264 bp^[5][6][7]

INTS6
Identifikatori
Aliasi	INTS6
Vanjski ID-jevi	OMIM: 604331 MGI: 1202397 HomoloGene: 8121 GeneCards: INTS6
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 13 (čovjek)[1] Bend 13q14.3 Početak 51,354,077 bp[1] Kraj 51,454,264 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 14 (miš)[2] Bend 14|14 D1 Početak 62,913,779 bp[2] Kraj 62,998,618 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • transmembrane signaling receptor activity Ćelijska komponenta • integrator complex • actin cytoskeleton • nukleoplazma • jedro Biološki proces • snRNA processing • snRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 Transdukcija signala • snRNA 3'-end processing Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	26512	18130
Ensembl	ENSG00000102786	ENSMUSG00000035161
UniProt	Q9UL03	Q6PCM2
RefSeq (mRNK)	NM_001039937 NM_001039938 NM_001306091 NM_012141	NM_008715
RefSeq (bjelančevina)	NP_001035026 NP_001035027 NP_001293020 NP_036273	NP_032741
Lokacija (UCSC)	Chr 13: 51.35 – 51.45 Mb	Chr 14: 62.91 – 63 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Proteini DEAD-kutija, karakterizirani konzerviranim motivom Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), pretpostavljene su RNK-helikaze. Protein kodiran ovim genom je DEAD boksni protein, koji je dio kompleksa koji stupa u interakciju sa C-terminalom RNK-polimeraze II i uključen je u 3' završnu preradu snRNK. Osim toga, ovaj gen je kandidat kao supresorski gen tumora i nalazi se u kritičnoj regiji gubitka heterozigotnosti (LOH). Za ovaj gen su pronađene tri varijante transkripta koje kodiraju dvije različite izoforme.^[7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 887 aminokiselina, a molekulska težina 100.390 Da.^[8]

10		20		30		40		50
MPILLFLIDT		SASMNQRSHL		GTTYLDTAKG		AVETFMKLRA		RDPASRGDRY
MLVTFEEPPY		AIKAGWKENH		ATFMNELKNL		QAEGLTTLGQ		SLRTAFDLLN
LNRLVTGIDN		YGQGRNPFFL		EPAIIITITD		GSKLTTTSGV		QDELHLPLNS
PLPGSELTKE		PFRWDQRLFA		LVLRLPGTMS		VESEQLTGVP		LDDSAITPMC
EVTGGRSYSV		CSPRMLNQCL		ESLVQKVQSG		VVINFEKAGP		DPSPVEDGQP
DISRPFGSQP		WHSCHKLIYV		RPNPKTGVPI		GHWPVPESFW		PDQNSPTLPP
RTSHPVVKFS		CTDCEPMVID		KLPFDKYELE		PSPLTQFILE		RKSPQTCWQV
YVSNSAKYSE		LGHPFGYLKA		STALNCVNLF		VMPYNYPVLL		PLLDDLFKVH
KAKPTLKWRQ		SFESYLKTMP		PYYLGPLKKA		VRMMGAPNLI		ADSMEYGLSY
SVISYLKKLS		QQAKIESDRV		IGSVGKKVVQ		ETGIKVRSRS		HGLSMAYRKD
FQQLLQGISE		DVPHRLLDLN		MKEYTGFQVA		LLNKDLKPQT		FRNAYDIPRR
NLLDHLTRMR		SNLLKSTRRF		LKGQDEDQVH		SVPIAQMGNY		QEYLKQVPSP
LRELDPDQPR		RLHTFGNPFK		LDKKGMMIDE		ADEFVAGPQN		KHKRPGEPNM
QGIPKRRRCM		SPLLRGRQQN		PVVNNHIGGK		GPPAPTTQAQ		PDLIKPLPLH
KISETTNDSI		IHDVVENHVA		DQLSSDITPN		AMDTEFSASS		PASLLERPTN
HMEALGHDHL		GTNDLTVGGF		LENHEEPRDK		EQCAEENIPA		SSLNKGKKLM
HCRSHEEVNT		ELKAQIMKEI		RKPGRKYERI		FTLLKHVQGS		LQTRLIFLQN
VIKEASRFKK		RMLIEQLENF		LDEIHRRANQ		INHINSN

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin