MIPEP

Mitohondrijska intermedijarna peptidaza je enzim koji je kod ljudi kodiran genom MIPEP.^[5]

MIPEP
Identifikatori
Aliasi	MIPEP
Vanjski ID-jevi	OMIM: 602241 MGI: 1917728 HomoloGene: 4337 GeneCards: MIPEP
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 13 (čovjek)[1] Bend 13q12.12 Početak 23,730,189 bp[1] Kraj 23,889,400 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 14 (miš)[2] Bend 14|14 D1 Početak 61,022,022 bp[2] Kraj 61,142,927 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • vezivanje iona metala • metalloendopeptidase activity Ćelijska komponenta • mitochondrial matrix • mitohondrija Biološki proces • peptide metabolic process • Proteoliza • protein processing involved in protein targeting to mitochondrion Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	4285	70478
Ensembl	ENSG00000027001	ENSMUSG00000021993
UniProt	Q99797	A6H611
RefSeq (mRNK)	NM_005932	NM_027436
RefSeq (bjelančevina)	NP_005923	NP_081712
Lokacija (UCSC)	Chr 13: 23.73 – 23.89 Mb	Chr 14: 61.02 – 61.14 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Ovaj protein je kritična komponenta mehanizma za import ljudskih mitohondrijskih proteina uključenih u proces sazrijevanja jedarno kodiranih mitohondrijskih proteina, s mitohondrijskim translokacijskim peptidima, posebno onih proteina povezanih s OXPHOS-om.^[6]

Struktura

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 713 aminokiselina, a molekulska težina 80.641 Da^[7]

10		20		30		40		50
MLCVGRLGGL		GARAAALPPR		RAGRGSLEAG		IRARRVSTSW		SPVGAAFNVK
PQGSRLDLFG		ERRGLFGVPE		LSAPEGFHIA		QEKALRKTEL		LVDRACSTPP
GPQTVLIFDE		LSDSLCRVAD		LADFVKIAHP		EPAFREAAEE		ACRSIGTMVE
KLNTNVDLYQ		SLQKLLADKK		LVDSLDPETR		RVAELFMFDF		EISGIHLDKE
KRKRAVDLNV		KILDLSSTFL		MGTNFPNKIE		KHLLPEHIRR		NFTSAGDHII
IDGLHAESPD		DLVREAAYKI		FLYPNAGQLK		CLEELLSSRD		LLAKLVGYST
FSHRALQGTI		AKNPETVMQF		LEKLSDKLSE		RTLKDFEMIR		GMKMKLNPQN
SEVMPWDPPY		YSGVIRAERY		NIEPSLYCPF		FSLGACMEGL		NILLNRLLGI
SLYAEQPAKG		EVWSEDVRKL		AVVHESEGLL		GYIYCDFFQR		ADKPHQDCHF
TIRGGRLKED		GDYQLPVVVL		MLNLPRSSRS		SPTLLTPSMM		ENLFHEMGHA
MHSMLGRTRY		QHVTGTRCPT		DFAEVPSILM		EYFANDYRVV		NQFARHYQTG
QPLPKNMVSR		LCESKKVCAA		ADMQLQVFYA		TLDQIYHGKH		PLRNSTTDIL
KETQEKFYGL		PYVPNTAWQL		RFSHLVGYGA		RYYSYLMSRA		VASMVWKECF
LQDPFNRAAG		ERYRREMLAH		GGGREPMLMV		EGMLQKCPSV		DDFVSALVSD
LDLDFETFLM		DSE

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Gen

Gen MIPEP kodira jednu metaloproteazu koja hidrolizira peptidni fragment od osam aminokiselina u dužini za obradu proteina usmjerenih na mitohondrije.^[5] Ljudski gen MIPEP ima 21 egzon i nalazi se na hromozomskoj sekvenci 13q12. Pokazano je da je ljudski gen MIPEP visoko eksprimiran u srcu, skeletnim mišićima i gušterači, tri organska sistema koji se često prijavljuju sa poremećajima OXPHOS-a.

Protein

Ljudski protein mitohondrijska intermedijarna peptidaza, veličine je 80,6 kDa i sastoji se od 713 aminokiselina. Sadrži mitonhondrije koje ciljaju peptid (aminokiselina 1-35 peptidne sekvence). Zreli protein ima teorijski pI 6,03.^[8]

Funkcija

Djelujući zajedno s općom mitohondrijskom procesnom peptidazom (MPP), MIPEP ima ključnu ulogu u sazrijevanju određene klase jedarno kodiranih proteinskih prekursora, koje karakterizira motiv, XRX (f) (F/L/I) XX (T/S /G) XXXX (f).^[9] U početku, peptidaza MPP cijepa prekursore na pozicijama dvije peptidne veze iz R-ostatka, ostavljajući tipski oktapeptid na N-kraju proteina; nakon toga, MIP cijepa oktapeptid, dovršavajući konačno sazrijevanje prerađenog proteina.^[10][11] Nedavno istraživanje pokazalo je da mitohondrijska intermedijarna peptidaza može razgraditi transmembranski receptor Notch na svom mjestu S5 i pomoći sazrijevanju notch proteina.^[12]

Klinički značaj

U GWAS (eng. Genome-Wide Association Study) studiji kineske populacije, zabilježena je značajna povezanost između visoke miopije i varijante na sekvenci q12.12 hromosoma 13. Geni MIPEP i C1QTNF9B nalaze se u istom lokusu i izgledaju eksprimirani u mrežnjači i njenom pigmentnom epitelu (RPE) i stoga su vjerojatno povezani s visokom kratkovidnošću.^[13] Međutim, funkcionalni dokazi koji povezuju MIPEP s kratkovidnošću tek trebaju biti pruženi.

Bialelne patogene varijante u MIPEP-u prisutne su u ranom dojenačkom uzrastu ili ranom djetinjstvu s hipotonijom (niskim mišićnim tonusom) i rijetkim tipom kardiomiopatije, koja se naziva nekompakcija lijeve komore. Mogu se vidjeti i katarakti. Kod četiri prijavljena pacijenta do sada je kardiomiopatija progresivna i rezultira smrću u prvih nekoliko godina života.^[14]