MRPS18B

Mitohondrijski 28S ribosomski protein S18b jest protein koji je kod ljudi kodiran genom MRPS18B.^[5][6]

MRPS18B
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 3J9M
Identifikatori
Aliasi	MRPS18B
Vanjski ID-jevi	OMIM: 611982 MGI: 1914223 HomoloGene: 32205 GeneCards: MRPS18B
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 6 (čovjek)[1] Bend 6p21.33 Početak 30,617,840 bp[1] Kraj 30,626,395 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 17 (miš)[2] Bend 17|17 B1 Početak 36,221,271 bp[2] Kraj 36,227,281 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • međućelijske veze • ribozom • nukleoplazma • intracellular anatomical structure • mitochondrial inner membrane • mitochondrial small ribosomal subunit • mitohondrija Biološki proces • mitochondrial translational elongation • Biosinteza bjelančevina • mitochondrial translational termination • mitochondrial translation Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	28973	66973
Ensembl	ENSG00000229861 ENSG00000226111 ENSG00000204568 ENSG00000203624 ENSG00000227420 ENSG00000233813 ENSG00000223775	ENSMUSG00000024436
UniProt	Q9Y676	Q99N84
RefSeq (mRNK)	NM_014046	NM_025878 NM_001347380 NM_001361453 NM_001361454 NM_001361455
RefSeq (bjelančevina)	NP_054765	NP_001334309 NP_080154 NP_001348382 NP_001348383 NP_001348384
Lokacija (UCSC)	Chr 6: 30.62 – 30.63 Mb	Chr 17: 36.22 – 36.23 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 258 aminokiselina, а molekulska težina 29.396 Da.^[7]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MAASVLNTVL		RRLPMLSLFR		GSHRVQVPLQ		TLCTKAPSEE		DSLSSVPISP
YKDEPWKYLE		SEEYQERYGS		RPVWADYRRN		HKGGVPPQRT		RKTCIRRNKV
VGNPCPICRD		HKLHVDFRNV		KLLEQFVCAH		TGIIFYAPYT		GVCVKQHKRL
TQAIQKARDH		GLLIYHIPQV		EPRDLDFSTS		HGAVSATPPA		PTLVSGDPWY
PWYNWKQPPE		RELSRLRRLY		QGHLQEESGP		PPESMPKMPP		RTPAEASSTG
QTGPQSAL

Funkcija

Mitohondrijski ribosomski proteini sisara kodirani su jedarnim genima i pomažu u sintezi proteina unutar mitohondrija. Mitohondrijski ribosomi (mitoribosomi) sastoje se od male podjedinice 28S i velike podjedinice 39S. Imaju procijenjenih 75% proteina prema rRNK sastavu u poređenju sa prokariotskim ribosomima, gdje je ovaj odnos obrnut.

Druga razlika između mitoribosoma sisara i prokariotskih ribosoma je ta što ovi drugi sadrže 5S rRNK. Među različitim vrstama, proteini koji se sastoje od mitoribosoma uveliko se razlikuju po sekvenci, a ponekad i po biohemijskim svojstvima, što sprečava lahko prepoznavanje homologija po sekvenci. Ovaj gen kodira protein podjedinice 28S koji pripada porodici ribosomnih proteina S18P. Kodirani protein jedan je od tri koji ima značajnu sličnost u sekvenci sa bakterijskim proteinima S18. Primarni transkripti tri ljudska mitohondrijska proteina S18 nisu međusobno bliskije povezane s prokariotskim proteinima S18. Pseudogeni koji odgovaraju ovom genu nalaze se na dugim kracima (q) hromozoma 1 i 2.^[6]