NOTCH2

Homologni protein 2 neurogenog lokusa notch znan i kao notch 2 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NOTCH2 sa hromosoma 1.^[5]

NOTCH2
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 2OO4
Identifikatori
Aliasi	NOTCH2
Vanjski ID-jevi	OMIM: 600275 MGI: 97364 HomoloGene: 7865 GeneCards: NOTCH2
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 1 (čovjek)[1] Bend 1p12 Početak 119,911,553 bp[1] Kraj 120,100,779 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 3 (miš)[2] Bend 3 F2.2|3 42.42 cM Početak 97,920,843 bp[2] Kraj 98,057,677 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • signaling receptor activity Ćelijska komponenta • citoplazma • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • membrana • Golđijeva membrana • receptor complex • ćelijska membrana • integral component of plasma membrane • nukleoplazma • extracellular region • cell surface • jedro Biološki proces • Notch signaling pathway • Ćelijska diferencijacija • Hematopoeza • pulmonary valve morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of Ras protein signal transduction • negative regulation of apoptotic process • marginal zone B cell differentiation • transcription, DNA-templated • nervous system development • stem cell population maintenance • multicellular organism development • atrial septum morphogenesis • GO:0090343, GO:0090342 regulation of developmental process • bone remodeling • animal organ morphogenesis • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • Notch signaling involved in heart development • GO:0097285 apoptoza • cell fate determination • intracellular receptor signaling pathway • negative regulation of gene expression • negative regulation of growth rate • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • regulation of osteoclast development • positive regulation of keratinocyte proliferation • regulation of actin cytoskeleton reorganization Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	4853	18129
Ensembl	ENSG00000134250	ENSMUSG00000027878
UniProt	Q04721	O35516
RefSeq (mRNK)	NM_001200001 NM_024408	NM_010928
RefSeq (bjelančevina)	NP_001186930 NP_077719	NP_035058
Lokacija (UCSC)	Chr 1: 119.91 – 120.1 Mb	Chr 3: 97.92 – 98.06 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

NOTCH2 vezan je za Alagilleov^[6] i Hajdu-Cheneyev sindrom.^[7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 2.471 aminokiselina, a molekulska težina 265.405 Da.^[8]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MPALRPALLW		ALLALWLCCA		APAHALQCRD		GYEPCVNEGM		CVTYHNGTGY
CKCPEGFLGE		YCQHRDPCEK		NRCQNGGTCV		AQAMLGKATC		RCASGFTGED
CQYSTSHPCF		VSRPCLNGGT		CHMLSRDTYE		CTCQVGFTGK		ECQWTDACLS
HPCANGSTCT		TVANQFSCKC		LTGFTGQKCE		TDVNECDIPG		HCQHGGTCLN
LPGSYQCQCP		QGFTGQYCDS		LYVPCAPSPC		VNGGTCRQTG		DFTFECNCLP
GFEGSTCERN		IDDCPNHRCQ		NGGVCVDGVN		TYNCRCPPQW		TGQFCTEDVD
ECLLQPNACQ		NGGTCANRNG		GYGCVCVNGW		SGDDCSENID		DCAFASCTPG
STCIDRVASF		SCMCPEGKAG		LLCHLDDACI		SNPCHKGALC		DTNPLNGQYI
CTCPQGYKGA		DCTEDVDECA		MANSNPCEHA		GKCVNTDGAF		HCECLKGYAG
PRCEMDINEC		HSDPCQNDAT		CLDKIGGFTC		LCMPGFKGVH		CELEINECQS
NPCVNNGQCV		DKVNRFQCLC		PPGFTGPVCQ		IDIDDCSSTP		CLNGAKCIDH
PNGYECQCAT		GFTGVLCEEN		IDNCDPDPCH		HGQCQDGIDS		YTCICNPGYM
GAICSDQIDE		CYSSPCLNDG		RCIDLVNGYQ		CNCQPGTSGV		NCEINFDDCA
SNPCIHGICM		DGINRYSCVC		SPGFTGQRCN		IDIDECASNP		CRKGATCING
VNGFRCICPE		GPHHPSCYSQ		VNECLSNPCI		HGNCTGGLSG		YKCLCDAGWV
GINCEVDKNE		CLSNPCQNGG		TCDNLVNGYR		CTCKKGFKGY		NCQVNIDECA
SNPCLNQGTC		FDDISGYTCH		CVLPYTGKNC		QTVLAPCSPN		PCENAAVCKE
SPNFESYTCL		CAPGWQGQRC		TIDIDECISK		PCMNHGLCHN		TQGSYMCECP
PGFSGMDCEE		DIDDCLANPC		QNGGSCMDGV		NTFSCLCLPG		FTGDKCQTDM
NECLSEPCKN		GGTCSDYVNS		YTCKCQAGFD		GVHCENNINE		CTESSCFNGG
TCVDGINSFS		CLCPVGFTGS		FCLHEINECS		SHPCLNEGTC		VDGLGTYRCS
CPLGYTGKNC		QTLVNLCSRS		PCKNKGTCVQ		KKAESQCLCP		SGWAGAYCDV
PNVSCDIAAS		RRGVLVEHLC		QHSGVCINAG		NTHYCQCPLG		YTGSYCEEQL
DECASNPCQH		GATCSDFIGG		YRCECVPGYQ		GVNCEYEVDE		CQNQPCQNGG
TCIDLVNHFK		CSCPPGTRGL		LCEENIDDCA		RGPHCLNGGQ		CMDRIGGYSC
RCLPGFAGER		CEGDINECLS		NPCSSEGSLD		CIQLTNDYLC		VCRSAFTGRH
CETFVDVCPQ		MPCLNGGTCA		VASNMPDGFI		CRCPPGFSGA		RCQSSCGQVK
CRKGEQCVHT		ASGPRCFCPS		PRDCESGCAS		SPCQHGGSCH		PQRQPPYYSC
QCAPPFSGSR		CELYTAPPST		PPATCLSQYC		ADKARDGVCD		EACNSHACQW
DGGDCSLTME		NPWANCSSPL		PCWDYINNQC		DELCNTVECL		FDNFECQGNS
KTCKYDKYCA		DHFKDNHCDQ		GCNSEECGWD		GLDCAADQPE		NLAEGTLVIV
VLMPPEQLLQ		DARSFLRALG		TLLHTNLRIK		RDSQGELMVY		PYYGEKSAAM
KKQRMTRRSL		PGEQEQEVAG		SKVFLEIDNR		QCVQDSDHCF		KNTDAAAALL
ASHAIQGTLS		YPLVSVVSES		LTPERTQLLY		LLAVAVVIIL		FIILLGVIMA
KRKRKHGSLW		LPEGFTLRRD		ASNHKRREPV		GQDAVGLKNL		SVQVSEANLI
GTGTSEHWVD		DEGPQPKKVK		AEDEALLSEE		DDPIDRRPWT		QQHLEAADIR
RTPSLALTPP		QAEQEVDVLD		VNVRGPDGCT		PLMLASLRGG		SSDLSDEDED
AEDSSANIIT		DLVYQGASLQ		AQTDRTGEMA		LHLAARYSRA		DAAKRLLDAG
ADANAQDNMG		RCPLHAAVAA		DAQGVFQILI		RNRVTDLDAR		MNDGTTPLIL
AARLAVEGMV		AELINCQADV		NAVDDHGKSA		LHWAAAVNNV		EATLLLLKNG
ANRDMQDNKE		ETPLFLAARE		GSYEAAKILL		DHFANRDITD		HMDRLPRDVA
RDRMHHDIVR		LLDEYNVTPS		PPGTVLTSAL		SPVICGPNRS		FLSLKHTPMG
KKSRRPSAKS		TMPTSLPNLA		KEAKDAKGSR		RKKSLSEKVQ		LSESSVTLSP
VDSLESPHTY		VSDTTSSPMI		TSPGILQASP		NPMLATAAPP		APVHAQHALS
FSNLHEMQPL		AHGASTVLPS		VSQLLSHHHI		VSPGSGSAGS		LSRLHPVPVP
ADWMNRMEVN		ETQYNEMFGM		VLAPAEGTHP		GIAPQSRPPE		GKHITTPREP
LPPIVTFQLI		PKGSIAQPAG		APQPQSTCPP		AVAGPLPTMY		QIPEMARLPS
VAFPTAMMPQ		QDGQVAQTIL		PAYHPFPASV		GKYPTPPSQH		SYASSNAAER
TPSHSGHLQG		EHPYLTPSPE		SPDQWSSSSP		HSASDWSDVT		TSPTPGGAGG
GQRGPGTHMS		EPPHNNMQVY		A

Funkcija

Notch 2 je član porodice notch. Članovi ove porodice transmembranskih proteina tipa 1 dijele strukturne karakteristike, uključujući vanćelijski domen koji se sastoji od višestrukih ponavljanja sličnih epidermnim faktorima rasta (EGF) i unutarćelijski domen koji se sastoji od više različitih tipova domena. Članovi porodice Notch imaju ulogu u raznim razvojnim procesima, kontrolišućirješenja o sudbini ćelije. Notch signalna mreža je evolucijski konzervirani međućelijski signalni put koji regulira interakcije između fizički susjednih ćelija. Kod Drosophila, interakcija Notch-a sa svojim ćelijskim ligandima (delta, serat) uspostavlja međućelijski signalni put koji ima ključnu ulogu u razvoju. Homolozi notch-liganda su također identifikovani kod ljudi, ali precizne interakcije između ovih liganada i ljudsjih homologa ostaju da se utvrde. Ovaj protein se cijepa u trans-Golgi mreži i edksprimira na površini ćelije kao heterodimer. Ovaj protein funkcionira kao receptor za ligande vezane za membranu i može imati ulogu u razvoju vaskularne mreže, bubrega i jetre.^[9]

Pokazalo se da su mutacije unutar posljednjeg kodirajućeg egzona Notch2 koje uklanjaju PEST domen i izbjegavaju nonsens posredovani raspad iRNK glavni uzrok Hajdu–Cheneyevog sindroma.^[10][11][12]

Interakcije

Pokazalo se da NOTCH2 ima interakcije sa:

• Deltalikim proteinom 1^[13][14][15]
• GSK3B,^[16]
• JAG1,^[13][14][17] i
• JAG2.^[14]