PHOX2B

Upareni homeoboks 2b (PHOX2B), znan i kao neuroblastom Phox (NBPhox), jest protein koji je kod ljudi kodiran genom PHOX2B sa hromosoma 4.^[5]

PHOX2B
Identifikatori
Aliasi	PHOX2B
Vanjski ID-jevi	OMIM: 603851 MGI: 1100882 HomoloGene: 68371 GeneCards: PHOX2B
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 4 (čovjek)[1] Bend 4p13 Početak 41,744,082 bp[1] Kraj 41,748,725 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 5 (miš)[2] Bend 5 C3.1|5 35.95 cM Početak 67,251,742 bp[2] Kraj 67,256,644 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • vezivanje sa DNK • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Ćelijska komponenta • jedro • nukleoplazma Biološki proces • negative regulation of cell population proliferation • glial cell differentiation • respiratory system development • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • medullary reticular formation development • transcription, DNA-templated • parasympathetic nervous system development • regulation of respiratory gaseous exchange by nervous system process • noradrenergic neuron development • cellular response to BMP stimulus • multicellular organism development • neural crest cell migration involved in autonomic nervous system development • hindbrain tangential cell migration • sympathetic nervous system development • skeletal muscle cell differentiation • enteric nervous system development • retrotrapezoid nucleus neuron differentiation • Regulacija ekspresije gena • positive regulation of neuron differentiation • brainstem development • inner ear development • cell development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • sympathetic ganglion development • negative regulation of neuron differentiation • cell differentiation in hindbrain • autonomic nervous system development • efferent axon development in a lateral line nerve • neuron differentiation • neuron migration • dopaminergic neuron differentiation • noradrenergic neuron differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cold-induced thermogenesis • nervous system development Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	8929	18935
Ensembl	ENSG00000109132	ENSMUSG00000012520
UniProt	Q99453	O35690
RefSeq (mRNK)	NM_003924	NM_008888
RefSeq (bjelančevina)	NP_003915	NP_032914
Lokacija (UCSC)	Chr 4: 41.74 – 41.75 Mb	Chr 5: 67.25 – 67.26 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 314 aminokiselina, а molekulska težina 31.621 Da.^[6]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MYKMEYSYLN		SSAYESCMAG		MDTSSLASAY		ADFSSCSQAS		GFQYNPIRTT
FGATSGCPSL		TPGSCSLGTL		RDHQSSPYAA		VPYKLFTDHG		GLNEKRKQRR
IRTTFTSAQL		KELERVFAET		HYPDIYTREE		LALKIDLTEA		RVQVWFQNRR
AKFRKQERAA		AAAAAAAKNG		SSGKKSDSSR		DDESKEAKST		DPDSTGGPGP
NPNPTPSCGA		NGGGGGGPSP		AGAPGAAGPG		GPGGEPGKGG		AAAAAAAAAA
AAAAAAAAAA		GGLAAAGGPG		QGWAPGPGPI		TSIPDSLGGP		FASVLSSLQR
PNGAKAALVK		SSMF

Funkcija

Ovaj gen kodira za homeodomenski faktor transkripcije. Eksprimira se isključivo u nervnom sistemu, u većini neurona koji kontrolišu unutrašnje organe (kardiovaskularni, probavni i respiratorni sistem). Potreban je i za njihovu diferencijaciju.

Imunohistohemija

Neophodan za diferencijaciju i preživljavanje simpatičkih neurona i hromafinskih ćelija, faktor transkripcije PHOX2B je visoko specifičan za periferni autonomni nervni sistem. Neuroblasti su izvedeni iz simpatonadbubrežne loze ćelija nervog grebena i stoga zahtevaju i konstitutivno eksprimiraju PHOX2B. Pokazalo se da je imunohistohemijsko bojenje PHOX2-a, kao marker derivacije nervnog grebena, osjetljiv i specifičan za nediferencirani neuroblastom, omogućavajući identifikaciju gdje ga drugi markeri ne prepoznaju među različitim malim okruglim plavim ćelijama djetinjstvenih tumora.^{[7][8][9][10]}

Dijagnostička korist bojenja PHOX2B-a proteže se na kasnije faze diferencijacije. Njegova snaga i specifičnost mogu otkriti mala žarišta neuroblastnih tumorskih metastataza u koštanoj srži, što je ključna identifikacija za određivanje stadija bolesti. Bojenje PHOX2B također prevazilazi česte prepreke otkrivanju neuroblastoma u uzorcima nakon tretmana, koji često pokazuju gustu fibrozu, istaknute upalne infiltrate i/ili difuznu kalcifikaciju.^[11]

Klinički značaj

Mutacije u ljudskom PHOX2B uzrokuju rijetku bolest visceralnog nervnog sistema (disautonomiju): kongenitalni centralni hipoventilacijski sindrom (povezan sa respiratornim zastojima tokom spavanja i, povremeno, budnosti), Hirschsprungovu bolest (parcijalna ageneza vegetativnog nervnog sistema), ROHHAD i tumore simpatičkih ganglija.

Kod većine ljudi, egzon 3 datog gena sadrži sekvencu od 20 polialaninskih ponavljanja. Povećanje broja ponavljanja povezano je s kongenitalnim centralnim hipoventilacijskim sindromom. Mogu postojati i druge patogene mutacije dalje duž gena.