PI4K2A

Fosfatidilinozitol 4-kinaza 2-alfa je enzim koji je kod ljudi kodiran genom PI4K2A.^[5][6][7]

PI4K2A
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 4HND, 4HNE, 4PLA, 4YC4, 5EUT, 5I0N
Identifikatori
Aliasi	PI4K2A
Vanjski ID-jevi	OMIM: 609763 MGI: 1934031 HomoloGene: 101681 GeneCards: PI4K2A
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 10 (čovjek)[1] Bend 10q24.2 Početak 97,640,686 bp[1] Kraj 97,676,434 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 19 (miš)[2] Bend 19 C3|19 35.74 cM Početak 42,078,909 bp[2] Kraj 42,110,526 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • aktivnost sa transferazom • nucleotide binding • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • AP-3 adaptor complex binding • ATP binding • magnesium ion binding • 1-phosphatidylinositol 4-kinase activity • GO:0032403 protein-containing complex binding Ćelijska komponenta • citosol • Golđijev aparat • projekcija ćelije • membrana • BLOC-1 complex • sinapsa • integral component of plasma membrane • lysosomal membrane • međućelijske veze • dendrit • mitohondrija • neuron projection • intrinsic component of membrane • Lipidni splav • GO:0016023 citoplazmatska vezikula • presynaptic membrane • endozom • trans-Golđijeva mreža • ćelijska membrana • growing cell tip • soma • host cell presynaptic membrane • synaptic vesicle membrane • early endosome membrane • GO:0009327 makromolekulani kompleks • perikaryon • intracellular membrane-bounded organelle • exocytic vesicle Biološki proces • Fosforilacija • phosphatidylinositol biosynthetic process • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • Golgi organization • endosome organization • basophil degranulation Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	55361	84095
Ensembl	ENSG00000155252	ENSMUSG00000025178
UniProt	Q9BTU6	Q2TBE6
RefSeq (mRNK)	NM_018425	NM_145501
RefSeq (bjelančevina)	NP_060895	NP_663476
Lokacija (UCSC)	Chr 10: 97.64 – 97.68 Mb	Chr 19: 42.08 – 42.11 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 479 aminokiselina, а molekulska težina 54.022 Da.^[8]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MDETSPLVSP		ERAQPPDYTF		PSGSGAHFPQ		VPGGAVRVAA		AAGSGPSPPG
SPGHDRERQP		LLDRARGAAA		QGQTQTVAAQ		AQALAAQAAA		AAHAAQAHRE
RNEFPEDPEF		EAVVRQAELA		IERCIFPERI		YQGSSGSYFV		KDPQGRIIAV
FKPKNEEPYG		HLNPKWTKWL		QKLCCPCCFG		RDCLVLNQGY		LSEAGASLVD
QKLELNIVPR		TKVVYLASET		FNYSAIDRVK		SRGKRLALEK		VPKVGQRFNR
IGLPPKVGSF		QLFVEGYKDA		DYWLRRFEAE		PLPENTNRQL		LLQFERLVVL
DYIIRNTDRG		NDNWLIKYDC		PMDSSSSRDT		DWVVVKEPVI		KVAAIDNGLA
FPLKHPDSWR		AYPFYWAWLP		QAKVPFSQEI		KDLILPKISD		PNFVKDLEED
LYELFKKDPG		FDRGQFHKQI		AVMRGQILNL		TQALKDNKSP		LHLVQMPPVI
VETARSHQRS		SSESYTQSFQ		SRKPFFSWW

Klasifikacija

Ovaj gen kodira fosfatidilinozitol 4-kinazu koja katalizira fosforilaciju fosfatidilinositola na položaju D-4, dajući fosfatidilinositol 4-fosfat (PI4P). Osim činjenice da PI4P služi kao prekursor za druge važne fosfoinozitide, poput fosfatidilinositol 4,5-bisfosfata, PI4P, neophodns je molekula u ćelijskoj signalizaciji i prometu posebno u Golgijevom aparatu i trans Golgijevoj mreži.

Fosfatidilinozitol 4-kinaze evolucijski su konzervirane među eukariotima i uključuju četiri ljudske izoforme

• fosfatidilinositol 4-kinaza alfa (PI4KA)
• fosfatidilinositol 4-kinaza beta (PI4KB)
• Fosfatidilinositol 4-kinaza 2-alfa (PI4K2A)
• fosfatidilinositol 4-kinaza 2-beta (PI4K2B)

Funkcija

Fosfatidilinositol 4-kinaza 2-alfa (PI4K2A) je najzastupljenija fosfatidilinozitol 4-kinaza u ljudskim ćelijama i odgovorna je za sintezu približno 50% ukupni PI4P unutar ćelije. PI4K2A je uglavnom povezan s membranama trans Golgijeve mreže i ranim i kasnim endosomima;^[9] njegova membranska povezanost postiže se teškom palmitoilacijom unutar specifičnog motiva bogatog cisteinom.^[10] Osim sinteze fosfatidilinositol 4,5-bisfosfata, PI4K2A je uključen u različite ćelijske procese, uključujući promjenu membrana, regulaciju endosomskog sortiranja, promovirajući regrutovanje ciljnih proteina u endosomima ili trans Golgijevoj mreži ili transdukciju signala. Posebno regulira npr. ciljanje kompleksa klatrinskog adaptera na Golgijev aparat,^[11] signalni EGFR signaling,^[12] ili Wnt-signalni put.^[13]

Klinički značaj

Disfunkcija PI4K2A može doprinijeti rastu tumora,^[14] spazamskoj paraplegiji,^[15] Gaucherovoj,^[16] ili Alzhemerovoj bolesti.^[17]

Struktura

Kinazni domen fosfatidilinositol 4-kinaze 2-alfa. N-režanj je obojen zlatno, C-režanj u akvamarinu, ATP na aktivnom mjestu između režnjeva u reprezentaciji štapića. PDB kod: 4PLA.^[18]

PI4K2A se sastoji od prolinom bogate N-terminalne regije i kinaznog domena koji se nalazi C-terminalno. Prolin-bogato N-terminalno područje sadrži fiziološki važna mjesta vezivanja za ubikvitin-ligazu Svrab ^[19] i klatrinski adapterski kompleks 3,^[20] ali je vjerojatno poremećen i nepotreban za aktivnost kinaze.^[21] Domen kinaza može se podijeliti na N-terminalne i C-završne režnjeve sa ATP veznim žljebom i navodnim fosfatidilinositolskim veznim džepom između . C-režanj domena kinaza sadrži dodatni bočni hidrofobni džep bez još dodijeljene posebne funkcije.^[18][22]