PI4KB

Fosfatidilinozitol 4-kinaza beta jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom PI4KB sa hromosoma 1.^[5][6][7]

PI4KB
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 4D0L, 4D0M, 4WAE, 4WAG, 5C4G, 5C46, 5EUQ
Identifikatori
Aliasi	PI4KB
Vanjski ID-jevi	OMIM: 602758 MGI: 1334433 HomoloGene: 6741 GeneCards: PI4KB
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 1 (čovjek)[1] Bend 1q21.3 Početak 151,291,797 bp[1] Kraj 151,327,715 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 3 (miš)[2] Bend 3|3 F2.1 Početak 94,882,042 bp[2] Kraj 94,914,154 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • kinase activity • nucleotide binding • aktivnost sa transferazom • 14-3-3 protein binding • 1-phosphatidylinositol 4-kinase activity Ćelijska komponenta • Endomembranski sistem • mitochondrial outer membrane • rough endoplasmic reticulum membrane • endozom • perinuklearno područje citoplazme • citosol • Endoplazmatski retikulum • citoplazma • Golđijev aparat • mitohondrija • membrana • Golđijeva membrana • intracellular anatomical structure Biološki proces • phosphatidylinositol biosynthetic process • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • receptor-mediated endocytosis • Fosforilacija • GO:0072468 Transdukcija signala • phosphatidylinositol-mediated signaling Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	5298	107650
Ensembl	ENSG00000143393	ENSMUSG00000038861
UniProt	Q9UBF8	Q8BKC8
RefSeq (mRNK)	NM_001198773 NM_001198774 NM_001198775 NM_002651 NM_001330721 NM_001369623 NM_001369624 NM_001369625 NM_001369626 NM_001369628 NM_001369629	NM_001293715 NM_001293716 NM_175356
RefSeq (bjelančevina)	NP_001185702 NP_001185703 NP_001185704 NP_001317650 NP_002642 NP_001356552 NP_001356553 NP_001356554 NP_001356555 NP_001356557 NP_001356558	NP_001280644 NP_001280645 NP_780565
Lokacija (UCSC)	Chr 1: 151.29 – 151.33 Mb	Chr 3: 94.88 – 94.91 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Klasifikacija

Ovaj gen kodira fosfatidilinozitol 4-kinazu koja katalizira fosforilaciju fosfatidilinozitola na D-4 poziciji, dajući fosfatidilinozitol 4-fosfat (PI4P). Osim činjenice da PI4P služi kao prekursor za druge važne fosfoinozitide, kao što je fosfatidilinozitol 4,5-bisfosfat, fosfatidilinozitol 4-fosfatnih molekula, učestvuje u ćelijskoj signalizaciji i prometu posebno u Golgijevom aparatu i trans Golgijevoj mreži.

Fosfatidilinozitol 4-kinaze evolucijski su konzervirane među eukariotima i uključuju četiri ljudske izoforme

• fosfatidilinozitol 4-kinaza alfa (PI4KA)
• fosfatidilinozitol 4-kinaza beta (PI4KB)
• fosfatidilinozitol 4-kinaza 2-alfa (PI4K2A)
• fosfatidilinozitol 4-kinaza 2-beta (PI4K2B)

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 816 aminokiselina, a molekulska težina 91.379 Da.^[8]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MGDTVVEPAP		LKPTSEPTSG		PPGNNGGSLL		SVITEGVGEL		SVIDPEVAQK
ACQEVLEKVK		LLHGGVAVSS		RGTPLELVNG		DGVDSEIRCL		DDPPAQIREE
EDEMGAAVAS		GTAKGARRRR		QNNSAKQSWL		LRLFESKLFD		ISMAISYLYN
SKEPGVQAYI		GNRLFCFRNE		DVDFYLPQLL		NMYIHMDEDV		GDAIKPYIVH
RCRQSINFSL		QCALLLGAYS		SDMHISTQRH		SRGTKLRKLI		LSDELKPAHR
KRELPSLSPA		PDTGLSPSKR		THQRSKSDAT		ASISLSSNLK		RTASNPKVEN
EDEELSSSTE		SIDNSFSSPV		RLAPEREFIK		SLMAIGKRLA		TLPTKEQKTQ
RLISELSLLN		HKLPARVWLP		TAGFDHHVVR		VPHTQAVVLN		SKDKAPYLIY
VEVLECENFD		TTSVPARIPE		NRIRSTRSVE		NLPECGITHE		QRAGSFSTVP
NYDNDDEAWS		VDDIGELQVE		LPEVHTNSCD		NISQFSVDSI		TSQESKEPVF
IAAGDIRRRL		SEQLAHTPTA		FKRDPEDPSA		VALKEPWQEK		VRRIREGSPY
GHLPNWRLLS		VIVKCGDDLR		QELLAFQVLK		QLQSIWEQER		VPLWIKPYKI
LVISADSGMI		EPVVNAVSIH		QVKKQSQLSL		LDYFLQEHGS		YTTEAFLSAQ
RNFVQSCAGY		CLVCYLLQVK		DRHNGNILLD		AEGHIIHIDF		GFILSSSPRN
LGFETSAFKL		TTEFVDVMGG		LDGDMFNYYK		MLMLQGLIAA		RKHMDKVVQI
VEIMQQGSQL		PCFHGSSTIR		NLKERFHMSM		TEEQLQLLVE		QMVDGSMRSI
TTKLYDGFQY		LTNGIM

Struktura

PI4KB se sastoji od prolinom bogatog N-terminalne regije, centralnog spiralnog domena i kinaznog domena koji se nalazi na C-terminalnom području. N-terminalna regija sadrži fiziološki važno mjesto vezivanja za Golgijev adapterski protein ACBD3, ali je vjerovatno poremećen i neophodan za aktivnost kinaze. Centralni spiralni domen odgovoran je za interakciju sa malom gvanozin trifosfatazom Rab11. Kinazni domen može se podijeliti na N-terminalne i C-terminalne režnjeve sa ATP- veznim žljebom i navodnim fosfatidilinozitolski veznim džepom u rascjep između režnjeva.^[9] Osim toga, u ekstremnom C-terminalnom području PI4KB, identificiran je motiv ALPS, što pogoduje njegovoj povezanosti s nezasićenim ili slabo zbijenim regijama membrane.^[10]

Helikski i kinazni domeni fosfatidilinozitol 4-kinaze beta sa nukleozidnim analogom.
Heliksni domen obojen je u lososu, N-režanj kinaznog domena u zlatu, C -režanj u akvamarinu, specifični inhibitor vezan na aktivnom mjestu između režnjeva u štapiću. PDB kod: 4WAG.

Funkcija

Fosfatidilinozitol 4-kinaza beta (PI4KB) je rastvorljivi protein koji se kreće između citoplazme i jedra,^[11] i može se uključiti u membrane Golgijevog sistema, putem interakcija protein-protein, npr. sa malim GTP-vezujućim proteinima Arf1^[12] i Rab11,^[13] ili proteinom Golgijevog adaptera ACBD3.^[14][15] PI4KB može biti fosforiliran pomoću protein-kinaze D,^[16] koji podstiče interakciju sa 14-3-3 proteinom i stabilizaciju proteina u njegovoj aktivnoj konformaciji.^[17] U citoplazmi, PI4KB regulira promet iz Golgijevog sistema u plazmamembranu, međutim, ostaje da se utvrdi njegova jedarna funkcija.

Klinički značaj

Širok spektar jednolančanih RNK virusa (npr. pikornavirus], uključujući mnoge važne ljudske patogene, uzimaju ljudsku PI4KB kinazu za stvaranje specifičnih fosfatidilinozitol 4-fosfatom obogaćenih organela koje se nazivaju membranske mreže.^[18] Ove organele se zatim koriste kao specifične platforme za efikasnu replikaciju virusa unutar ćelije domaćina.

Nadalje, homolog PI4KB iz protozojskog parazita Plasmodium falciparum identificiran je kao meta imidopirazina, klase antimalarijskih spojeva.^[19]