PRR4

Prolinom bogati protein 4 je protein koji je kod ljudi kodiran genom PRR4.^[3][4] Suzni prolinom bogati protein i je član porodice prolinom bogatih proteina kojoj nedostaje konzervirani ponavljajući domen. Može imati ulogu u zaštitnim funkcijama oka.

PRR4
Identifikatori
Aliasi	PRR4
Vanjski ID-jevi	OMIM: 605359 HomoloGene: 48512 GeneCards: PRR4
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 12 (čovjek)[1] Bend 12p13.2 Početak 10,845,849 bp[1] Kraj 10,849,475 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	11272	n/a
Ensembl	ENSG00000111215 ENSG00000282269 ENSG00000263247	n/a
UniProt	Q16378	n/a
RefSeq (mRNK)	NM_007244 NM_001098538	n/a
RefSeq (bjelančevina)	NP_001092008 NP_009175	n/a
Lokacija (UCSC)	Chr 12: 10.85 – 10.85 Mb	n/a
PubMed pretraga	[2]	n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Analizom 1.780.295 5'-krajnjih sekvenci ljudskih cDNK pune dužine izvedenih iz 164 vrste biblioteka cDNK sa oligokapom, identificirano je 269.774 nezavisnih položaja transkripcijskih početnih lokacija (TSS) za 14.628 ljudskih gena RefSeq. Ovi TSS -ovi su grupirani u 30.964 klastera koji su međusobno odvojeni za više od 500 bp i stoga će vrlo vjerojatno predstavljati međusobno različite alternativne promotere. Na iznenađenje, najmanje 7.674 (52%) ljudskih gena RefSeq podložno je regulaciji putem navodnih alternativnih promotora (PAP). U prosjeku, bilo je 3,1 PAP po genu, sa sastavom jednog promotora koji sadrži CpG-ostrvo na 2,6 promotora bez CpG. U 17% lokusa koji sadrže PAP uočena je upotreba PAP-a specifična za tkivo. Najbogatiji tkivni izvori tkivno specifičnih PAP-ova bili su sjemenici i mozak.

Također je bilo zanimljivo da su promotori koji sadrže PAP bili obogaćeni genima koji kodiraju proteine povezane sa transdukcijom signala i bili su rjeđi u genima koji kodiraju vanćelijske proteine, što je vjerojatno odražavalo različite funkcionalne zahtjeve za i ograničenu ekspresiju tih kategorija gena. Obrasci prvih egzona također su bili veoma različiti. U prosjeku, bilo je 7,7 različitih tipova prerade prvih egzona po lokusu, djelomično proizvedenih PAP–ovima, što sugerira da se ovim mehanizmom može postići veliki broj transkripata. Nalazi ukazuju na to da bi upotreba zamjenskih promotora i posljedična alternativna upotreba prvih egzona trebali imati ključnu ulogu u stvaranju složenosti potrebne za visoko razrađene molekulske sisteme kod ljudi.^[5]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 134 aminokiseline, a molekulska težina 15.097 Da.^[6]

10		20		30		40		50
MLLVLLSVVL		LALSSAQSTD		NDVNYEDFTF		TIPDVEDSSQ		RPDQGPQRPP
PEGLLPRPPG		DSGNQDDGPQ		QRPPKPGGHH		RHPPPPPFQN		QQRPPRRGHR
QLSLPRFPSV		SLQEASSFFQ		RDRPARHPQE		QPLW

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin