RECQL4

ATP-ovisna DNK-helikaza Q4 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom RECQL4.^[5][6][7]

RECQL4
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 2KMU
Identifikatori
Aliasi	RECQL4
Vanjski ID-jevi	OMIM: 603780 MGI: 1931028 HomoloGene: 3144 GeneCards: RECQL4
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 8 (čovjek)[1] Bend 8q24.3 Početak 144,511,288 bp[1] Kraj 144,517,845 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 15 (miš)[2] Bend 15|15 D3 Početak 76,587,753 bp[2] Kraj 76,594,748 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • ATP-dependent DNA/DNA annealing activity • nucleotide binding • GO:0043140 3'-5' DNA helicase activity • bubble DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • GO:1990163 four-way junction helicase activity • oxidized purine DNA binding • telomeric D-loop binding • vezivanje sa DNK • single-stranded DNA binding Ćelijska komponenta • membrana • citoplazma • jedro • Telomera • hromosom Biološki proces • multicellular organism development • GO:0100026 Popravka DNK • base-excision repair • double-strand break repair via homologous recombination • DNA recombination • Replikacija DNK • DNA duplex unwinding • telomeric D-loop disassembly • telomere maintenance • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • positive regulation of DNA replication • DNA unwinding involved in DNA replication Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	9401	79456
Ensembl	ENSG00000160957	ENSMUSG00000033762
UniProt	O94761	Q75NR7
RefSeq (mRNK)	NM_004260	NM_058214
RefSeq (bjelančevina)	NP_004251	NP_478121
Lokacija (UCSC)	Chr 8: 144.51 – 144.52 Mb	Chr 15: 76.59 – 76.59 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 1.208 aminokiselina, а molekulska težina 133.077 Da.^[8].

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MERLRDVRER		LQAWERAFRR		QRGRRPSQDD		VEAAPEETRA		LYREYRTLKR
TTGQAGGGLR		SSESLPAAAE		EAPEPRCWGP		HLNRAATKSP		QPTPGRSRQG
SVPDYGQRLK		ANLKGTLQAG		PALGRRPWPL		GRASSKASTP		KPPGTGPVPS
FAEKVSDEPP		QLPEPQPRPG		RLQHLQASLS		QRLGSLDPGW		LQRCHSEVPD
FLGAPKACRP		DLGSEESQLL		IPGESAVLGP		GAGSQGPEAS		AFQEVSIRVG
SPQPSSSGGE		KRRWNEEPWE		SPAQVQQESS		QAGPPSEGAG		AVAVEEDPPG
EPVQAQPPQP		CSSPSNPRYH		GLSPSSQARA		GKAEGTAPLH		IFPRLARHDR
GNYVRLNMKQ		KHYVRGRALR		SRLLRKQAWK		QKWRKKGECF		GGGGATVTTK
ESCFLNEQFD		HWAAQCPRPA		SEEDTDAVGP		EPLVPSPQPV		PEVPSLDPTV
LPLYSLGPSG		QLAETPAEVF		QALEQLGHQA		FRPGQERAVM		RILSGISTLL
VLPTGAGKSL		CYQLPALLYS		RRSPCLTLVV		SPLLSLMDDQ		VSGLPPCLKA
ACIHSGMTRK		QRESVLQKIR		AAQVHVLMLT		PEALVGAGGL		PPAAQLPPVA
FACIDEAHCL		SQWSHNFRPC		YLRVCKVLRE		RMGVHCFLGL		TATATRRTAS
DVAQHLAVAE		EPDLHGPAPV		PTNLHLSVSM		DRDTDQALLT		LLQGKRFQNL
DSIIIYCNRR		EDTERIAALL		RTCLHAAWVP		GSGGRAPKTT		AEAYHAGMCS
RERRRVQRAF		MQGQLRVVVA		TVAFGMGLDR		PDVRAVLHLG		LPPSFESYVQ
AVGRAGRDGQ		PAHCHLFLQP		QGEDLRELRR		HVHADSTDFL		AVKRLVQRVF
PACTCTCTRP		PSEQEGAVGG		ERPVPKYPPQ		EAEQLSHQAA		PGPRRVCMGH
ERALPIQLTV		QALDMPEEAI		ETLLCYLELH		PHHWLELLAT		TYTHCRLNCP
GGPAQLQALA		HRCPPLAVCL		AQQLPEDPGQ		GSSSVEFDMV		KLVDSMGWEL
ASVRRALCQL		QWDHEPRTGV		RRGTGVLVEF		SELAFHLRSP		GDLTAEEKDQ
ICDFLYGRVQ		ARERQALARL		RRTFQAFHSV		AFPSCGPCLE		QQDEERSTRL
KDLLGRYFEE		EEGQEPGGME		DAQGPEPGQA		RLQDWEDQVR		CDIRQFLSLR
PEEKFSSRAV		ARIFHGIGSP		CYPAQVYGQD		RRFWRKYLHL		SFHALVGLAT
EELLQVAR

Funkcija

Mutacije u RECQL4 povezane su s autosomno recesivnom bolešću Rothmund-Thomsonov sindrom, poremećajem koji ima obilježja preranog starenja.^[9][10] Osim Rothmund-Thomsonovog sindroma, mutacije RECQL4 su također povezane sa RAPADILINO-om i Baller-Geroldovim sindromom.^[11] Postoje dva tipa Rothmund-Thomsonovog sindroma, a tip 2 se javlja kod pacijenata koji nose štetne mutacije u obje kopije gena RECQL4. Ovo stanje je povezano s visokim rizikom od razvoja osteosarkoma (zloćudni tumor kostiju).^[12] RECQL4 je imenovan po tome što je homologan (po podudarnosti sekvence) s ostalim članovima porodice RecQ-helikaza. Dvije druge genetičke bolesti su posljedica mutacija u drugim helikazama RECQ. Bloomov sindrom povezan je s mutacijama u BLM genu, a Wernerov sindrom s mutacijama u 'WRN genu.^[13]

Popravak DNK

Dvolančani prekidi u DNK potencijalno su smrtonosni za ćeliju i moraju se popraviti. Popravljanje dvolančanih prekida pomoću homologne rekombinacije (HR) važan je ćelijski mehanizam za izbjegavanje ove smrtonosnosti. RECQL4 ima ključnu ulogu u prvom koraku HR -a, koji se naziva završna resekcija.^[14] Kada je RECQL4 nedostatan, krajnja resekcija, a time i HR, se smanjuju. Dokazi ukazuju da drugi oblici popravljanja DNK, uključujući nehomologno spajanje krajeva, popravljanje ekscizije nukleotida i popravljanje ekscizije baza također ovise o funkciji RECQL4.^[10] U Rothmund-Thomsonovom sindromu, povezanost deficitarne popravke DNK posredovane RECQL4 i preranog starenja u skladu je sa teorijom starenja oštećenjem DNK.