SPAG11B

Spermopridruženi antigen 11B je protein koji je kod ljudi kodiran genom SPAG11B.^[5][6][7]

SPAG11B
Identifikatori
Aliasi	SPAG11B
Vanjski ID-jevi	OMIM: 606560 MGI: 3647173 HomoloGene: 83383 GeneCards: SPAG11B
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 8 (čovjek)[1] Bend 8p23.1 Početak 7,442,684 bp[1] Kraj 7,463,674 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 8 (miš)[2] Bend 8|8 A1.3 Početak 19,190,775 bp[2] Kraj 19,193,026 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • molekularna funkcija Ćelijska komponenta • extracellular region Biološki proces • Spermatogeneza • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • defense response • defense response to bacterium Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	10407	546038
Ensembl	ENSG00000164871 ENSG00000274405 ENSG00000288309	ENSMUSG00000059463
UniProt	Q08648 Q6PDA7	Q8K4N2 Q3UW43
RefSeq (mRNK)	NM_016512 NM_058200 NM_058201 NM_058202 NM_058203 NM_058206 NM_058207	NM_001034905 NM_001039563 NM_001286493
RefSeq (bjelančevina)	NP_057596 NP_478107 NP_478108 NP_478109 NP_478110 NP_478113 NP_478114 NP_001075021 NP_001350655 NP_001075021 NP_001350655	NP_694755 NP_001030077 NP_001034652 NP_001273422
Lokacija (UCSC)	Chr 8: 7.44 – 7.46 Mb	Chr 8: 19.19 – 19.19 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 103 aminokiseline, а molekulska težina 11.431 Da.^[8]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MRQRLLPSVT		SLLLVALLFP		GSSQARHVNH		SATEALGELR		ERAPGQGTNG
FQLLRHAVKR		DLLPPRTPPY		QVHISHREAR		GPSFRICVDF		LGPRWARGCS
TGN

Funkcija

Ovaj gen kodira nekoliko androgeno zavisnih, epididimisno specifičnih sekretornih proteina. Specifične funkcije ovih proteina nisu utvrđene, ali se smatra da su uključene u sazrijevanje spermatozoida. Neke od izoformi sadrže regije slične beta-defenzinima, porodice antimikrobnih peptida. Gen se nalazi na hromosomu 8, sekvenca p23, u blizini klastera gena za defenzin. Alternativna prerada ovog gena rezultira sa sedam varijanti transkripta koje kodiraju različite izoforme. Dvije različite N-terminalne i pet različitih C-terminalnih proteinskih sekvenci kodirane su prerađenim varijantama. Opisane su dvije dodatne varijante, ali njihove pune sekvence nisu utvrđene.^[7]