TIMMDC1

TIMMDC1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TIMMDC1 sa hromosoma 3.^[5][6] To je šaaperonski protein uključen u izgradnju membranskog kraka mitohondrijskog kompleksa I.^[7] Pokazalo se da mutacija pomaka okvira u intronu ovog gena uzrokuje neuspjeh u razvoju, zaostajanje psihomotornog razvoja, infantilni početak hipotonije i tešku neurološku disfunkciju.^[8] Visoka ekspresija ovog gena povezana je sa migracijom ćelija raka pluća, dok se pokazalo da iscrpljivanje proteina utiče na regulaciju apoptoza, ćelijski ciklus i migracije ćelija.^[9]

TIMMDC1
Identifikatori
Aliasi	TIMMDC1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 615534 MGI: 1922139 HomoloGene: 9578 GeneCards: TIMMDC1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 3 (čovjek)[1] Bend 3q13.33 Početak 119,498,547 bp[1] Kraj 119,525,090 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 16 (miš)[2] Bend 16|16 B4 Početak 38,318,709 bp[2] Kraj 38,343,025 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • integral component of membrane • mitochondrial inner membrane • membrana • mitohondrija • mitochondrial membranes • nukleoplazma • jedro Biološki proces • mitochondrial respiratory chain complex I assembly Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	51300	76916
Ensembl	ENSG00000113845	ENSMUSG00000002846
UniProt	Q9NPL8	Q8BUY5
RefSeq (mRNK)	NM_016589	NM_024273
RefSeq (bjelančevina)	NP_057673	NP_077235
Lokacija (UCSC)	Chr 3: 119.5 – 119.53 Mb	Chr 16: 38.32 – 38.34 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 285 aminokiselina, а molekulska težina 32.178 Da.^[10]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MEVPPPAPRS		FLCRALCLFP		RVFAAEAVTA		DSEVLEERQK		RLPYVPEPYY
PESGWDRLRE		LFGKDEQQRI		SKDLANICKT		AATAGIIGWV		YGGIPAFIHA
KQQYIEQSQA		EIYHNRFDAV		QSAHRAATRG		FIRYGWRWGW		RTAVFVTIFN
TVNTSLNVYR		NKDALSHFVI		AGAVTGSLFR		INVGLRGLVA		GGIIGALLGT
PVGGLLMAFQ		KYSGETVQER		KQKDRKALHE		LKLEEWKGRL		QVTEHLPEKI
ESSLQEDEPE		NDAKKIEALL		NLPRNPSVID		KQDKD

Struktura

Gen TIMMDC1 nalazi se na q kraku hromosoma 3 na poziciji 13.33 i obuhvata 25.760 parova baza, sa sedam egzona.^[6] Gen proizvodi protein od 32,2 kDa sastavljen od 285 aminokiselina.^[11][12] Protein TIMMDC1 ima četiri transmembranska domena, sa N– i C-terminalnim ekstenzijama u mitohondrijskom matriksu. TIMMDC1 je multiprolazni protein unutrašnje mitohondrijske membrane , za koji se predviđa da je član 4-prolazne transmembrane porodice proteina TIM17–TIM22–TIM23. Predviđa se da će njegova topologija biti analogna TIMM23.^[13]

Funkcija

TIMMDC1 je proteinski šaperon uključen u sklapanje mitohondrijskog kompleksa I (NADH-ubikvinon-oksidoreduktaze), koji učestvuje u izgradnji membranskog kraka kompleksa I.^[7]

Klinički značaj

Pokazalo se da mutacija pomaka okvira u intronu 5 gena TIMMDC1 uzrokuje tešk neurološke disfunkcije, infantilni početak hipotonija, zaostatak psihomotornog razvoja, i neuspjeh u razvoju.^[8] Dodatno, visoka ekspresija TIMMDC1 povezana je sa metastazama ćelija karcinoma pluća, sa iscrpljivanjem proteina koji inhibira rast i migraciju 95D ćelija karcinoma pluća. Takođe se pokazalo da iscrpljivanje TIMMDC1 mijenja ekspresiju gena uključenih u regulaciju apoptoze, zaustavljanje ćelijskog ciklusa i migraciju ćelija, uključujući CCNG2, PTEN, TIMP3 i COL3A1.^[9]

Interakcije

Protein TIMMDC1 ima interakcije sa srednjim potkompleksom od 315 kDa nepotpuno sastavljenog kompleksa I i ima interakcije sa FATE1, pored oko 60 ostalih proteina.^[7][14] TIMMDC1 se recipročno povezuje sa više komponenti ECSIT-TMEM126B-ACAD9-NDUFAF1 faktora sklapanja kompleksa (MCIA-kompleks).^[13]