XPA

Protein za popravku DNK koji nadopunjuje ćelije XP-A je protein koji je kod ljudi kodiran genom XPA , sa hromosoma 9.^[4]

XPA
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 1D4U, 1XPA, 2JNW
Identifikatori
Aliasi	XPA
Vanjski ID-jevi	OMIM: 611153 MGI: 99135 HomoloGene: 37298 GeneCards: XPA
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 4 (miš)[1] Bend 4 B1|4 24.49 cM Početak 46,155,347 bp[1] Kraj 46,196,311 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • vezivanje iona metala • protein domain specific binding • protein homodimerization activity • vezivanje sa DNK • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • oštećeno vezivanje sa DNK Ćelijska komponenta • intercellular bridge • Replikacijski protein A • nucleotide-excision repair factor 1 complex • jedro • nukleoplazma • citoplazma Biološki proces • nucleotide-excision repair, DNA incision • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • transcription-coupled nucleotide-excision repair • GO:0001306 response to oxidative stress • cellular response to DNA damage stimulus • response to auditory stimulus • multicellular organism growth • global genome nucleotide-excision repair • response to toxic substance • response to UV • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • Popravak ekscizijom nukleotida • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair • UV-damage excision repair • base-excision repair • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • GO:0100026 Popravka DNK • UV protection • protein localization to nucleus • regulation of autophagy • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	7507	22590
Ensembl	ENSG00000136936	ENSMUSG00000028329
UniProt	P23025	Q64267
RefSeq (mRNK)	NM_000380	NM_011728
RefSeq (bjelančevina)	NP_000371 NP_001341904	NP_035858
Lokacija (UCSC)	n/a	Chr 4: 46.16 – 46.2 Mb
PubMed pretraga	[2]	[3]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 273 aminokiseline, а molekulska masa — 31.368 Da.^[4]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MAAADGALPE		AAALEQPAEL		PASVRASIER		KRQRALMLRQ		ARLAARPYSA
TAAAATGGMA		NVKAAPKIID		TGGGFILEEE		EEEEQKIGKV		VHQPGPVMEF
DYVICEECGK		EFMDSYLMNH		FDLPTCDNCR		DADDKHKLIT		KTEAKQEYLL
KDCDLEKREP		PLKFIVKKNP		HHSQWGDMKL		YLKLQIVKRS		LEVWGSQEAL
EEAKEVRQEN		REKMKQKKFD		KKVKELRRAV		RSSVWKRETI		VHQHEYGPEE
NLEDDMYRKT		CTMCGHELTY		EKM

Funkcija

Nukleotidni ekscizijski popravak (NER) je glavni put za popravak raznih glomaznih oštećenja DNK, uključujući i ona unesena UV zračenjem. Čini se da XPA protein ima ključnu ulogu u NER-u na mjestima oštećenja kao skela za druge proteine za popravak kako bi se osiguralo da su oštećenja na odgovarajući način izrezana.^[5] Među proteinima za popravak s kojima XPA stupa u interakciju je proteinski kompleks (uključujući ERCC1 protein) koji je sposoban urezati DNK na mjestima oštećenja.^[6]

Xpa mutantne osobe često pokazuju teške kliničke simptome xeroderma pigmentosum, stanja koje uključuje ekstremnu osjetljivost na sunčevu svjetlost i visoku učestalost raka kože.

Interakcije

Pokazano je da XPA ima interakcije sa ERCC1,^[6][7] replikacijskim proteinom A1^[8] i XAB2.^[9]