EMP1

Epitelni membranski protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom EMP1.^[5][6][7]

EMP1
Identifikatori
Aliasi	EMP1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 602333 MGI: 107941 HomoloGene: 1088 GeneCards: EMP1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 12 (čovjek)[1] Bend 12p13.1 Početak 13,196,723 bp[1] Kraj 13,219,941 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 6 (miš)[2] Bend 6 G1|6 66.25 cM Početak 135,339,543 bp[2] Kraj 135,360,171 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • ćelijska membrana • membrana • integral component of membrane Biološki proces • multicellular organism development • bleb assembly • Ćelijska proliferacija • Ćelijska smrt • epidermis development Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	2012	13730
Ensembl	ENSG00000134531	ENSMUSG00000030208
UniProt	P54849	P47801
RefSeq (mRNK)	NM_001423	NM_001288627 NM_001288628 NM_010128
RefSeq (bjelančevina)	NP_001414	NP_001275556 NP_001275557 NP_034258
Lokacija (UCSC)	Chr 12: 13.2 – 13.22 Mb	Chr 6: 135.34 – 135.36 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 157 aminokiselina, a molekulska težina 17.563 Da.^[8]

10		20		30		40		50
MLVLLAGIFV		VHIATVIMLF		VSTIANVWLV		SNTVDASVGL		WKNCTNISCS
DSLSYASEDA		LKTVQAFMIL		SIIFCVIALL		VFVFQLFTME		KGNRFFLSGA
TTLVCWLCIL		VGVSIYTSHY		ANRDGTQYHH		GYSYILGWIC		FCFSFIIGVL
YLVLRKK

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija

Ben-Porath i Benvenisty (1996) klonirali su cDNK koja kodira protein-1 epitelne membrane (EMP1), koji su po njima nazvali TMP, koristeći RT-PCR na RNK bubrega ljudskog embrija.^[9]

Ruegg et al. (1996) nezavisno su izolirali cDNK koja kodira EMP1, zvani B4B, koristeći PCR na diferencijalnom zaslonu. Predviđeni protein EMP1 sa 157 aminokiselina sadrži četiri transmembranska domena i dva potencijalna N-kraj-vezana mjesta glikozilacije u prvoj vanćelijskoj petlji.^[10]

Chen et al. (1997.) otkrili su da EMP1, po njima nazvan CL-20, dijeli 39% identiteta aminokiselina s perifernim mijelinskim proteinom-22 (PMP22); konzervirane aminokiseline nalaze se pretežno unutar domena koje pokrivaju membrane. Koristeći Northern blot analizu, otkrili su transkript EMP1 od 2,8 kb u većini pregledanih tkiva odraslih, ali ne i u mozgu, jetri, gušterači ili leukocitima periferne krvi. Zbog visoke homologije aminokiselinskih sekvenci među PMP22, EMP1, EMP2 i EMP3, Ben-Porath i Benvenisty (1996) su predložili da su ti proteini članovi nove porodice. Koristeći RT-PCR, otkrili su ekspresiju EMP1 u embrionskom bubregu, mozgu i crijevima, ali ne i u jetri i timusu. Na temelju predloženih funkcija PMP22, predložili su da je EMP1 uključen u interakcije ćelija-ćelija i kontrolu ćelijske proliferacije.

Struktura gena

Chen et al (1997) otkrili su da gen EMP1 sadrži pet egzona i četiri introna, te su primijetili da se spojevi egzona/introna nalaze na istim pozicijama kao i PMP22, sugerirajući da su EMP1 i PMP22 nastali duplikacijom zajedničkog predačkog gena.^[11] Marvin et al (1995) lokalizirali su gen EMP1 u hromosomu 12 pomoću hibridne ploče somatskih ćelija. fluorescentnom hibridizacijom in situ, Chen et al. (1997.) i Ruegg et al. (1996.) mapirali su gen EMP1 na 12p12, odnosno sekvencu 20q12-q13.1. Pomoću FISH -a, hibridizacije somatskih ćelija i hibridne analize zračenjem, Liehr et al. (1999) potvrdili su dodjeljivanje EMP1 gena hromosomu 12p12.3. Ben Porath et al. (1998) mapirali su homologni gen miša u hromosomu 6.^[12][13][14]

Gefitinib je hemoterapeutsko sredstvo koje se natječe za mjesto vezanja ATP-a na EGF receptoru (EGFR; 131550). Za proučavanje rezistencije na gefitinib u tumorima, Jain et al. (2005) razvili su adenokarcinomski ksenotransplant rezistentan na gefitinib kod golih miševa. Dobijanje rezistencije na gefitinib koreliralo je s površinskom ekspresijom Emp1. Ekspresija EMP1 je također u korelaciji sa smanjenim odgovorom na gefitinib u uzorcima pacijenata sa karcinomom pluća, kao i sa kliničkom progresijom do sekundarne rezistencije na gefitinib. Ekspresija EMP1 i rezistencija na gefitinib nisu bili ovisni o mutacijama EGFR-a osjetljivim na gefitinib.^[15]