HDAC1
From Wikipedia, the free encyclopedia
Remove ads
Histon-deacetilaza 1 (HDAC1) jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom HDAC1 sa hromosoma 1.[5]
Remove ads
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 482 aminokiseline, a molekulska težina Da. 55.103[6]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MAQTQGTRRK | VCYYYDGDVG | NYYYGQGHPM | KPHRIRMTHN | LLLNYGLYRK | ||||
| MEIYRPHKAN | AEEMTKYHSD | DYIKFLRSIR | PDNMSEYSKQ | MQRFNVGEDC | ||||
| PVFDGLFEFC | QLSTGGSVAS | AVKLNKQQTD | IAVNWAGGLH | HAKKSEASGF | ||||
| CYVNDIVLAI | LELLKYHQRV | LYIDIDIHHG | DGVEEAFYTT | DRVMTVSFHK | ||||
| YGEYFPGTGD | LRDIGAGKGK | YYAVNYPLRD | GIDDESYEAI | FKPVMSKVME | ||||
| MFQPSAVVLQ | CGSDSLSGDR | LGCFNLTIKG | HAKCVEFVKS | FNLPMLMLGG | ||||
| GGYTIRNVAR | CWTYETAVAL | DTEIPNELPY | NDYFEYFGPD | FKLHISPSNM | ||||
| TNQNTNEYLE | KIKQRLFENL | RMLPHAPGVQ | MQAIPEDAIP | EESGDEDEDD | ||||
| PDKRISICSS | DKRIACEEEF | SDSEEEGEGG | RKNSSNFKKA | KRVKTEDEKE | ||||
| KDPEEKKEVT | EEEKTKEEKP | EAKGVKEEVK | LA |
4
Remove ads
Funkcija
Acetilacija i deacetilacija histona, katalizirana kompleksima više podjedinica, ima ključnu ulogu u regulaciji eukariotske ekspresije gena. Protein kodiran ovim genom pripada porodici histon deacetilaza/acuc/alfa i komponenta je kompleksa histon-deacetilaza. Također je u interakciji sa proteinom supresorom tumora retinoblastoma i ovaj kompleks je ključni element u kontroli proliferacije i diferencijacije ćelija. Zajedno s proteinom-2 MTA2 povezanim s metastazama, deacetilira p53 i modulira njegov učinak na rast i ćelijsku apoptozu.[7]
Remove ads
Modelni organizmi
U proučavanju funkcije HDAC1 korišteni su modelni organizmi. Uvjetna linija nokaut-miševa, zvana Hdac1tm1a(EUCOMM)Wtsi[12][13] gwnwrirana je kao dio programa Međunarodnog konzorcija za nokaut-miševe — visokoprolpusnog projekta mutageneze za generiranje i distribuciju modela životzinjskih bolesti zainteresiranim naučnicima — na Institutu Wellcome Trust Sanger.[14][15][16] Mužjaci i ženke podvrgnute su standardiziranom fenotipskom pregledu kako bi se utvrdili efekti delecija.[10][17] Obavljeno je 25 testova i prijavljena su dva nenormalna fenotipa. Tokom gestacije identifikovan je smanjen broj homozigotnih mutantnih embriona, a nijedan nije preživio do odbijanja. Preostali testovi su obavljeni na heterozigot nimmutantnim odraslim miševima i kod ovih životinja nisu uočene značajne abnormalnosti.[10]
Interakcije
Pokazalo se da HDAC1 interraguje sa:
- Androgeni receptor,[18]
- BCL6,[19][20]
- BTG2,[21][22]
- BUB1B,[23]
- BUB1,[23]
- BUB3,[23]
- CBFA2T3,[24][25]
- CDC20,[23]
- CDH1,[23]
- CHD3,[26][27]
- CHD4,[26][28][29]
- COUP-TFII,[30]
- CTBP1,[31][32][33]
- DDX17,[34]
- DDX5,[34]
- DNMT3A,[35]
- DNMT3L,[36][37]
- DAP6,[38]
- EED,[39]
- EVI1,[40][41]
- EZH2,[39]
- FKBP3,[42]
- GATA1,[43]
- HMG20B,[44]
- HSPA4,[45]
- HUS1,[46]
- HD2,[26][28][39][44][45][47][48][49][50][51][52][53][54]
- TGIF1,[31][55]
- HCFC1,[56]
- IFRD1,[57]
- IKZF1,[58][59]
- ING1,[27][60]
- MBD3,[52][61][62]
- MIER1,[63]
- MLL,[64]
- MTA1,[28][65]
- MTA2,[28][52][66][67]
- Mad1,[23]
- Mdm2,[68]
- CPGBP2,[52][69][70]
- MADH2,[71]
- MyoD,[72][73]
- NFKB1,[74]
- NRCR2,[47][75]
- P21,[76]
- PCNA,[77]
- PHF21A,[44][78]
- Prohibitin,[79][80]
- PLP,[81][82]
- RAD9A,[46]
- RBBP4,[28][29][52][53][54][66][69][83][84][85][86]
- RBBP7,[28][52][54][69]
- RCOR1,[44][66]
- RELA,[51][74][87]
- RFC1,[88]
- Retinoblastoma protein,[72][80][89][90][91][92][93]
- RMP1,[89][90]
- RMP2,[89][94]
- SAP30,[27][52][95][96][97][98]
- SATB1,[67]
- SIN3A,[26][27][28][29][52][53][66][67][83][84][99][100][101][102]
- SIN3B,[52][58]
- SPEN,[103]
- SUDS3,[99][104]
- SUV39H1,[105]
- STF,[84][106][107][108]
- TOP2A,[109][110]
- TOP2B,[109][110] i
- ZFBTB16.[19][111][112]
Remove ads
Također pogledajte
- Histon-deacetilaza
- Inhibitor histon-deacetilaze
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Wikiwand - on
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Remove ads