MTRF1

Mitohondrijski faktor 1 translacijskog oslobađanja, znan i kao MTRF1 je ljudski gen na hromosomu 13, sekvenca 13q14.11, između bazmih prova 41,216.369 i 41,263.577.^[5][6]

MTRF1
Identifikatori
Aliasi	MTRF1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 604601 MGI: 2384815 HomoloGene: 20903 GeneCards: MTRF1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 13 (čovjek)[1] Bend 13q14.11 Početak 41,216,369 bp[1] Kraj 41,263,577 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 14 (miš)[2] Bend 14|14 D3 Početak 79,635,212 bp[2] Kraj 79,661,027 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • translation release factor activity • translation release factor activity, codon specific • ribosome binding Ćelijska komponenta • mitohondrija • citoplazma Biološki proces • translational termination • regulation of translational termination • Biosinteza bjelančevina • mitochondrial translational termination Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	9617	211253
Ensembl	ENSG00000120662	ENSMUSG00000022022
UniProt	O75570 Q8N6Z2	Q8K126
RefSeq (mRNK)	NM_004294 NM_001354073 NM_001354074 NM_001354076	NM_145960
RefSeq (bjelančevina)	NP_004285 NP_001341002 NP_001341003 NP_001341005	NP_666072
Lokacija (UCSC)	Chr 13: 41.22 – 41.26 Mb	Chr 14: 79.64 – 79.66 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Protein kodiran ovim genom usmjerava završetak translacije kao odgovor na peptidnu sekvencu terminacijskih kodonia. U početku se smatralo da ima ulogu u prekidu sinteze mitohondrijskih proteina. Pretpostavljeno je da mtRF1 kod kičmenjaka prepoznaje nestandardne stop kodone AGA i AGG. Alternativno, na temelju detaljnog 3D modeliranja, predloženo je da se prepoznaju zaostali ribosomi, u kojima je tRNK još uvijek vezana za peptidni lanac, ali u kojima je ribosomsko A-mjesto prazno.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 445 aminokiselina, a molekulska težina 52 306 Da.^[7]

10		20		30		40		50
MNRHLCVWLF		RHPSLNGYLQ		CHIQLHSHQF		RQIHLDTRLQ		VFRQNRNCIL
HLLSKNWSRR		YCHQDTKMLW		KHKALQKYME		NLSKEYQTLE		QCLQHIPVNE
ENRRSLNRRH		AELAPLAAIY		QEIQETEQAI		EELESMCKSL		NKQDEKQLQE
LALEERQTID		QKINMLYNEL		FQSLVPKEKY		DKNDVILEVT		AGRTTGGDIC
QQFTREIFDM		YQNYSCYKHW		QFELLNYTPA		DYGGLHHAAA		RISGDGVYKH
LKYEGGIHRV		QRIPEVGLSS		RMQRIHTGTM		SVIVLPQPDE		VDVKLDPKDL
RIDTFRAKGA		GGQHVNKTDS		AVRLVHIPTG		LVVECQQERS		QIKNKEIAFR
VLRARLYQQI		IEKDKRQQQS		ARKLQVGTRA		QSERIRTYNF		TQDRVSDHRI
AYEVRDIKEF		LCGGKGLDQL		IQRLLQSADE		EAIAELLDEH		LKSAK

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin