NRIP1

Jedarni receptor-interaktivni protein 1 (NRIP1), znan i kao receptor-interaktivni protein 140 (RIP140) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NRIP1 sa hromosoma 21.^[5][6]

NRIP1
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 2GPO, 2GPP, 4S14, 4S15
Identifikatori
Aliasi	NRIP1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 602490 MGI: 1315213 HomoloGene: 2606 GeneCards: NRIP1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 21 (čovjek)[1] Bend 21q11.2-q21.1 Početak 14,961,235 bp[1] Kraj 15,065,936 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 16 (miš)[2] Bend 16|16 C3.1 Početak 76,084,288 bp[2] Kraj 76,170,715 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • glucocorticoid receptor binding • signaling receptor binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • retinoid X receptor binding • histone deacetylase binding • androgen receptor binding • core promoter sequence-specific DNA binding • retinoic acid receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • estrogen receptor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Ćelijska komponenta • Jedarce • histone deacetylase complex • nuclear speck • jedro • nukleoplazma Biološki proces • ritmički proces • transcription, DNA-templated • Ovulacija • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • lipid storage • androgen receptor signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to estradiol stimulus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ovarian follicle rupture • circadian regulation of gene expression • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Jednodnevni biološki ritam Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	8204	268903
Ensembl	ENSG00000180530	ENSMUSG00000048490
UniProt	P48552	Q8CBD1
RefSeq (mRNK)	NM_003489	NM_173440 NM_001358238
RefSeq (bjelančevina)	NP_003480	NP_775616 NP_001345167
Lokacija (UCSC)	Chr 21: 14.96 – 15.07 Mb	Chr 16: 76.08 – 76.17 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Jedarnu receptor-intersktivni proteinski 1 represije 1
Identifikatori
Simbol	NRIP1 repr-1

Jedarni receptor-interaktivni protein 1 represije 2
Identifikatori
Simbol	NRIP1-repr-2

Jedarni receptor-interaktivni protein 1 represije 3
Identifikatori
Simbol	NRIP1-repr-3

Jedarmi receptor-interaktivni protein 1 represije 4
Identifikatori
Simbol	NRIP1-repr-4

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 1.158 aminokiselina, a molekulska težina 126.942 Da.^[7]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MTHGEELGSD		VHQDSIVLTY		LEGLLMHQAA		GGSGTAVDKK		SAGHNEEDQN
FNISGSAFPT		CQSNGPVLNT		HTYQGSGMLH		LKKARLLQSS		EDWNAAKRKR
LSDSIMNLNV		KKEALLAGMV		DSVPKGKQDS		TLLASLLQSF		SSRLQTVALS
QQIRQSLKEQ		GYALSHDSLK		VEKDLRCYGV		ASSHLKTLLK		KSKVKDQKPD
TNLPDVTKNL		IRDRFAESPH		HVGQSGTKVM		SEPLSCAARL		QAVASMVEKR
ASPATSPKPS		VACSQLALLL		SSEAHLQQYS		REHALKTQNA		NQAASERLAA
MARLQENGQK		DVGSYQLPKG		MSSHLNGQAR		TSSSKLMASK		SSATVFQNPM
GIIPSSPKNA		GYKNSLERNN		IKQAANNSLL		LHLLKSQTIP		KPMNGHSHSE
RGSIFEESST		PTTIDEYSDN		NPSFTDDSSG		DESSYSNCVP		IDLSCKHRTE
KSESDQPVSL		DNFTQSLLNT		WDPKVPDVDI		KEDQDTSKNS		KLNSHQKVTL
LQLLLGHKNE		ENVEKNTSPQ		GVHNDVSKFN		TQNYARTSVI		ESPSTNRTTP
VSTPPLLTSS		KAGSPINLSQ		HSLVIKWNSP		PYVCSTQSEK		LTNTASNHSM
DLTKSKDPPG		EKPAQNEGAQ		NSATFSASKL		LQNLAQCGMQ		SSMSVEEQRP
SKQLLTGNTD		KPIGMIDRLN		SPLLSNKTNA		VEENKAFSSQ		PTGPEPGLSG
SEIENLLERR		TVLQLLLGNP		NKGKSEKKEK		TPLRDESTQE		HSERALSEQI
LMVKIKSEPC		DDLQIPNTNV		HLSHDAKSAP		FLGMAPAVQR		SAPALPVSED
FKSEPVSPQD		FSFSKNGLLS		RLLRQNQDSY		LADDSDRSHR		NNEMALLESK
NLCMVPKKRK		LYTEPLENPF		KKMKNNIVDA		ANNHSAPEVL		YGSLLNQEEL
KFSRNDLEFK		YPAGHGSASE		SEHRSWARES		KSFNVLKQLL		LSENCVRDLS
PHRSNSVADS		KKKGHKNNVT		NSKPEFSISS		LNGLMYSSTQ		PSSCMDNRTF
SYPGVVKTPV		SPTFPEHLGC		AGSRPESGLL		NGCSMPSEKG		PIKWVITDAE
KNEYEKDSPR		LTKTNPILYY		MLQKGGNSVT		SRETQDKDIW		REASSAESVS
QVTAKEELLP		TAETKASFFN		LRSPYNSHMG		NNASRPHSAN		GEVYGLLGSV
LTIKKESE

Funkcija

Protein 1 koji interaguje s jedarnim receptorom (NRIP1) je jedarni protein koji specifično stupa u interakciju sa hormonski ovisnim aktivacijskim domenom AF2 jedarnih receptora. Također poznat kao RIP140, ovaj protein je ključni regulator koji modulira transkripcijsku aktivnost raznih transkripcionih faktora, uključujući estrogeni receptor.^[7]

RIP140 ima važnu ulogu u regulaciji metabolizma lipida i glukoze,^[8] i reguliše ekspresije gena u metaboličkim tkivima uključujući srčano,^[9] skeletal muscle,^[10] i jetreno .^[11] Glavna uloga RIP140 u masnom tkivu je da blokira ekspresiju gena uključenih u disipaciju energije i odvajanje mitohondrija, uključujući razdvajanje proteina 1 i karnitin palmitoiltransferazu 1b.^[12]

Estrogen-srodni receptor alfa (ERRa) može aktivirati RIP140 tokom adipogeneze, putem direktnog vezivanja za element estrogenog receptora /ERR elementa i indirektno preko Sp1 vezivanja za proksimalni promotivni dio.^[13]

RIP140 potiskuje ekspresiju mitohondrijskih proteina sukcinat-dehidrogenaza kompleksa b i CoxVb i djeluje kao negativni regulator uzimanja glukoze kod miševa.^[14]

Studije nokauta

Nokaut-miševi kojima potpuno nedostaje molekula RIP140 su vitki i ostaju vitki, čak i na bogatoj ishrani.^[15]

Ženke nokaut.miševe također su neplodne jer ne uspijevaju ovulirati.^[16] Neuspjeh ovulacije kod ovih miševa uzrokovan je nedostatkom ekspanzije cumulus i promijenjenom ekspresijom različitih gena, uključujući amfiregulin, u jajničkim folikulima.^[17][18]

Klinički značaj

RIP140 je dio lanca kojim tumori mogu uzrokovati kaheksiju.^[19][20]

Nivoi ekspresije RIP140 u različitim tkivima variraju tokom starenja kod miševa, što ukazuje na promjene u metaboličkoj funkciji.^[21] RIP140 je uključen u određene procese bolesti kod ljudi. Kod morbidne gojaznosti, nivoi RIP140 su smanjeni u visceralnom masnom tkivu.^[22] Kod raka dojke, RIP140 je uključen u regulaciju E2F1, onkogena koji diferencira lumenske i bazne tipove tumora. RIP140 ima uticaj na fenotip i prognozu raka.^[23] Osim toga, RIP140 ima ulogu u upalama, jer djeluje kao koaktivator za NFkappaB/RelA zavisnu citokinsku ekspresiju gena. Nedostatak RIP140 dovodi do inhibicije proupalnih puteva u makrofaga.^[24]

Interakcije

Pokazalo se da je NRIP1 u interakciji sa:

• AHR,^[25]
• CTBP1^[26][27]
• CTBP2,^[26][28]
• DAX1,^[29]
• HDAC5,^[26]
• NR1B1,^[30][31][32]
• NR2B1,^[31][32]
• NR3A1,^[5][32][33]
• NR3C1,^[34][35][36]
• NR5A1,^[29][37] i
• YWHAQ.^[34]

Također pogledajte

• Transkripcijski koregulator