PIWIL1

Piwi-liki protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom PIWIL1.^[5][6][7]

PIWIL1
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 2L5C, 2L5D, 3O3I, 3O6E, 3O7V
Identifikatori
Aliasi	PIWIL1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 605571 MGI: 1928897 HomoloGene: 37963 GeneCards: PIWIL1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 12 (čovjek)[1] Bend 12q24.33 Početak 130,337,887 bp[1] Kraj 130,372,637 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 5 (miš)[2] Bend 5 G1.3|5 67.86 cM Početak 128,779,588 bp[2] Kraj 128,832,538 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • protein kinase binding • vezivanje sa RNK • single-stranded RNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • mRNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • endoribonuclease activity • hydrolase activity • vezivanje iona metala • piRNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • polysome binding • mRNA cap binding complex binding Ćelijska komponenta • polysome • jedro • mRNA cap binding complex • dense body • P granule • citoplazma • chromatoid body Biološki proces • multicellular organism development • regulation of translation • GO:0007126 Mejoza • Ćelijska diferencijacija • Utišavanje gena • Spermatogeneza • negative regulation of transposition • piRNA metabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • spermatid development Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	9271	57749
Ensembl	ENSG00000275051 ENSG00000125207	ENSMUSG00000029423
UniProt	Q96J94	Q9JMB7
RefSeq (mRNK)	NM_001190971 NM_004764	NM_021311
RefSeq (bjelančevina)	NP_001177900 NP_004755	NP_067286
Lokacija (UCSC)	Chr 12: 130.34 – 130.37 Mb	Chr 5: 128.78 – 128.83 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira člana potporodice PIWI argonaut proteina, evolucijski konzrrvirAnih proteina koji sadrže i PAZ i Piwi motive, sa važnom ulogom u samoobnavljanju matičnih ćelija , supresiji RNK i translacijskoj regulaciji u različitim organizmima.

Kodirani protein može imati ulogu unutrašnjeg regulatora sposobnosti samoobnavljanja zametne linije i hematopoetskih matičnih ćelija. Brojni geni identificirani su kao članovi porodice argonaut, u različitim neljudskim organizmima i smatra se da ti geni imaju važnu ulogu u razvoju i održavanju matičnih ćelija zametne linije. Ljudska porodica argonaut, sastoji se od osam članova. Proteini koji se proizvode od ovih članova porodice zadržavaju zajedničku arhitekturu sa PAZ motivom u sredini i Piwi motivom u C-terminalnoj regiji. Na osnovu poređenja sekvenci, osam članova porodice argonaut klasifikovano je u dvije potporodice: PIWI (PIWIL1/HIWI, PIWIL2/HILI, PIWIL3 i PIWIL4/HIWI2) i potporodicu eIF2C/AGO (EIF2C1/hAG hAGO2, EIF2C3/hAGO3 i EIF2C4/hAGO4). PCR analiza pomoću panela ljudskih cDNK s višestrukim tkivom pokazala je da su sva četiri člana PIWI potporodice eksprimirana uglavnom u sjemenicima, a sva četiri člana potporodice eIF2C/AGO u različitim tkivima odraslih. Eksperimenti imunoprecipitacije i vezivanja sa afinitetom koristeći ljudske HEK293 ćelije kotransfektirane cDNK za DICER sa oznakom FLAG, član porodice ribonukleaza III i članovi porodice argonaut označeni His-om, sugerirali su da su proteini iz članova obje potporodice povezani s DICER-om. Pretpostavlja se da bi barem neki članovi ljudske porodice argonauta mogli biti uključeni u razvoj i održavanje matičnih ćelijaa putem mehanizama za supresiju gena, posredovanih RNK, povezanih s DICER-om.^[7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 861 aminokiselina, a molekulska težina 98.603 Da.^[8].

10		20		30		40		50
MTGRARARAR		GRARGQETAQ		LVGSTASQQP		GYIQPRPQPP		PAEGELFGRG
RQRGTAGGTA		KSQGLQISAG		FQELSLAERG		GRRRDFHDLG		VNTRQNLDHV
KESKTGSSGI		IVRLSTNHFR		LTSRPQWALY		QYHIDYNPLM		EARRLRSALL
FQHEDLIGKC		HAFDGTILFL		PKRLQQKVTE		VFSKTRNGED		VRITITLTNE
LPPTSPTCLQ		FYNIIFRRLL		KIMNLQQIGR		NYYNPNDPID		IPSHRLVIWP
GFTTSILQYE		NSIMLCTDVS		HKVLRSETVL		DFMFNFYHQT		EEHKFQEQVS
KELIGLVVLT		KYNNKTYRVD		DIDWDQNPKS		TFKKADGSEV		SFLEYYRKQY
NQEITDLKQP		VLVSQPKRRR		GPGGTLPGPA		MLIPELCYLT		GLTDKMRNDF
NVMKDLAVHT		RLTPEQRQRE		VGRLIDYIHK		NDNVQRELRD		WGLSFDSNLL
SFSGRILQTE		KIHQGGKTFD		YNPQFADWSK		ETRGAPLISV		KPLDNWLLIY
TRRNYEAANS		LIQNLFKVTP		AMGMQMRKAI		MIEVDDRTEA		YLRVLQQKVT
ADTQIVVCLL		SSNRKDKYDA		IKKYLCTDCP		TPSQCVVART		LGKQQTVMAI
ATKIALQMNC		KMGGELWRVD		IPLKLVMIVG		IDCYHDMTAG		RRSIAGFVAS
INEGMTRWFS		RCIFQDRGQE		LVDGLKVCLQ		AALRAWNSCN		EYMPSRIIVY
RDGVGDGQLK		TLVNYEVPQF		LDCLKSIGRG		YNPRLTVIVV		KKRVNTRFFA
QSGGRLQNPL		PGTVIDVEVT		RPEWYDFFIV		SQAVRSGSVS		PTHYNVIYDN
SGLKPDHIQR		LTYKLCHIYY		NWPGVIRVPA		PCQYAHKLAF		LVGQSIHREP
NLSLSNRLYY		L

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin