SOX21

Transkripcijski faktor SOX-21 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SOX21 ^[5][6] Član je porodice transkripcijskih faktora Sox .

SOX21
Identifikatori
Aliasi	SOX21
Vanjski ID-jevi	OMIM: 604974 MGI: 2654070 HomoloGene: 5143 GeneCards: SOX21
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 13 (čovjek)[1] Bend 13q32.1 Početak 94,709,622 bp[1] Kraj 94,712,545 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 14 (miš)[2] Bend 14|14 E4 Početak 118,470,644 bp[2] Kraj 118,474,442 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • vezivanje sa DNK • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Ćelijska komponenta • jedro • ćelijska komponenta Biološki proces • hair follicle development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • hair cycle • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • skin development • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Ćelijska diferencijacija • central nervous system development • neuron differentiation Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	11166	223227
Ensembl	ENSG00000125285	ENSMUSG00000061517
UniProt	Q9Y651	Q811W0
RefSeq (mRNK)	NM_007084	NM_177753
RefSeq (bjelančevina)	NP_009015	NP_808421
Lokacija (UCSC)	Chr 13: 94.71 – 94.71 Mb	Chr 14: 118.47 – 118.47 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 276 aminokiselina, a molekulska težina 28.580 Da.^[7]

10		20		30		40		50
MSKPVDHVKR		PMNAFMVWSR		AQRRKMAQEN		PKMHNSEISK		RLGAEWKLLT
ESEKRPFIDE		AKRLRAMHMK		EHPDYKYRPR		RKPKTLLKKD		KFAFPVPYGL
GGVADAEHPA		LKAGAGLHAG		AGGGLVPESL		LANPEKAAAA		AAAAAARVFF
PQSAAAAAAA		AAAAAAGSPY		SLLDLGSKMA		EISSSSSGLP		YASSLGYPTA
GAGAFHGAAA		AAAAAAAAAG		GHTHSHPSPG		NPGYMIPCNC		SAWPSPGLQP
PLAYILLPGM		GKPQLDPYPA		AYAAAL

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Funkcija

U embrionu kokoši, Sox21 promovira neuronsku ćelijskudiferencijaciju, suzbijajući aktivnost Sox1, Sox2 i Sox3, koji održavaju neuronske ćelije u nediferenciranom stanju.^[8]

SOX21 nokaut-miševs eksprimira gubitak dlake, počevši od 11. dana nakon porođaja. Ponovni rast započeo je nekoliko dana kasnije, ali je uslijedio ponovni gubitak dlake. Sox21 je također eksprimiran i u kutikulaama dlake kod ljudi, pa bi varijante gena Sox21 mogle biti odgovorne za neka stanja opadanja kose.^[9]

Također pogledajte

• SOX geni