XPO4

Eksportin-4 je protein koji je kod ljudi kodiran genom XPO4. Citogenetička lokacija ovog gena je na hromosomu 13, sekvenca: 13q12.11, a genomske koordinte (GRCh38): 13:20,777.328 – 20,902.773 bp (prema NCBI).

XPO4
Identifikatori
Aliasi	XPO4
Vanjski ID-jevi	OMIM: 611449 MGI: 1888526 HomoloGene: 10733 GeneCards: XPO4
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 13 (čovjek)[1] Bend 13q12.11 Početak 20,777,329 bp[1] Kraj 20,903,048 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 14 (miš)[2] Bend 14|14 C3 Početak 57,577,521 bp[2] Kraj 57,665,430 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • nuclear export signal receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • jedrova pora • jedro • nukleoplazma • citoplazma • citosol Biološki proces • positive regulation of protein export from nucleus • protein transport • nuclear export • protein export from nucleus Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	64328	57258
Ensembl	ENSG00000132953	ENSMUSG00000021952
UniProt	Q9C0E2	Q9ESJ0
RefSeq (mRNK)	NM_022459 NM_001372061	NM_020506
RefSeq (bjelančevina)	NP_071904 NP_001358990	NP_065252 NP_001355626 NP_001355627
Lokacija (UCSC)	Chr 13: 20.78 – 20.9 Mb	Chr 14: 57.58 – 57.67 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

XPO4 pripada velikoj porodici karioferina, koji posreduju u transportu proteina i drugog tereta između jedarnog i citoplazmatskog odjeljka (Lipowsky et al., 2000).^[5][6][7][8]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 1.154 aminokiseline, a molekulska težina 130.139 Da.^[9].

10		20		30		40		50
MMAAALGPPE		VIAQLENAAK		VLMAPPSMVN		NEQRQHAEHI		FLSFRKSKSP
FAVCKHILET		SKVDYVLFQA		ATAIMEAVVR		EWILLEKGSI		ESLRTFLLTY
VLQRPNLQKY		VREQILLAVA		VIVKRGSLDK		SIDCKSIFHE		VSQLISSGNP
TVQTLACSIL		TALLSEFSSS		SKTSNIGLSM		EFHGNCKRVF		QEEDLRQIFM
LTVEVLQEFS		RRENLNAQMS		SVFQRYLALA		NQVLSWNFLP		PNLGRHYIAM
FESSQNVLLK		PTESWRETLL		DSRVMELFFT		VHRKIREDSD		MAQDSLQCLA
QLASLHGPIF		PDEGSQVDYL		AHFIEGLLNT		INGIEIEDSE		AVGISSIISN
LITVFPRNVL		TAIPSELFSS		FVNCLTHLTC		SFGRSAALEE		VLDKDDMVYM
EAYDKLLESW		LTLVQDDKHF		HKGFFTQHAV		QVFNSYIQCH		LAAPDGTRNL
TANGVASREE		EEISELQEDD		RDQFSDQLAS		VGMLGRIAAE		HCIPLLTSLL
EERVTRLHGQ		LQRHQQQLLA		SPGSSTVDNK		MLDDLYEDIH		WLILVTGYLL
ADDTQGETPL		IPPEIMEYSI		KHSSEVDINT		TLQILGSPGE		KASSIPGYNR
TDSVIRLLSA		ILRVSEVESR		AIRADLTHLL		SPQMGKDIVW		FLKRWAKTYL
LVDEKLYDQI		SLPFSTAFGA		DTEGSQWIIG		YLLQKVISNL		SVWSSEQDLA
NDTVQLLVTL		VERRERANLV		IQCENWWNLA		KQFASRSPPL		NFLSSPVQRT
LMKALVLGGF		AHMDTETKQQ		YWTEVLQPLQ		QRFLRVINQE		NFQQMCQQEE
VKQEITATLE		ALCGIAEATQ		IDNVAILFNF		LMDFLTNCIG		LMEVYKNTPE
TVNLIIEVFV		EVAHKQICYL		GESKAMNLYE		ACLTLLQVYS		KNNLGRQRID
VTAEEEQYQD		LLLIMELLTN		LLSKEFIDFS		DTDEVFRGHE		PGQAANRSVS
AADVVLYGVN		LILPLMSQDL		LKFPTLCNQY		YKLITFICEI		FPEKIPQLPE
DLFKSLMYSL		ELGMTSMSSE		VCQLCLEALT		PLAEQCAKAQ		ETDSPLFLAT
RHFLKLVFDM		LVLQKHNTEM		TTAAGEAFYT		LVCLHQAEYS		ELVETLLSSQ
QDPVIYQRLA		DAFNKLTASS		TPPTLDRKQK		MAFLKSLEEF		MANVGGLLCV
K

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija

Sekvenciranjem klonova dobijenih iz cDNK biblioteke hipokampusa frakcionirane veličine odraslih, Nagase et al. (2000) klonirali XPO4, koji su označili kao KIAA1721. 3' UTR sadrži ponavljajuću sekvencu, a protein od 1.150 aminokiselina dijeli 99% identiteta aminokiselina s mišjim Xpo4. RT-PCR ELISA testom otkrili su visoku do umjerenu ekspresiju u svim ljudskim tkivima i određenim regijama mozga.^[10]

Korištenje afinitetne hromatografije na imobiliziranom RanGTP-u, za identifikaciju novih proteina koji vežu RanGTP u ekstraktu ćelije HeLa, nakon čega slijedi analiza baze podataka i 3' i 5' RACE, Lipowsky et al. (2000) klonirali mišji Xpo4, koji su nazvali Exp4. Izvedeni mišji protein od 1.170 aminokiselina ima izračunatu molekulsku masu od 129,9 kD. Xpo4 ima sličnost u odnosu na motiv vezivanja za N-terminalni RanGTP sa članovima porodice importin-beta, sa najvećom sličnošću sa eksportinom-1 (XPO1) i eksportnim receptorom tRNK exportina-t (XPOT).

Funkcija gena

Korištenjem rekombinantnog Xpo4 eksprimiranog u komponentama ćelije E. coli i ćelija HeLa, Lipowsky et al. (2000) pokazali su da je vezan za RanGTP Xpo4, odnosno EIF5A i timidilat sintazu (TYMS). Imunobloting test rekombinantnog EIF5A i vezanog Xpo4 pokazao je da EIF5A specifično formira kompleks EIF5A-Xpo4-RanGTP sa Xpo4 i da je interakcija Xpo4-EIF5A poboljšana u prisustvu RanGTP. Analize jedarnog ekspotra u permeabiliziranim ćelijama pokazale su da Xpo4 posreduje u specifičnom jedarnom eksportu EIF5A. Analizom mutacija i posttranslacijskih modifikacija, zaključili su da je interakcija Xpo4-EIF5A složena i zahtijeva velike dijelove molekula EIF5A i hipusinsku modifikaciju EIF5A.^[11]

Također pogledajte

• Hromosom 13
• Ran (gen)
• SMAD3