| 代 | 氏名 | 在職期間 | 出身校・期 | 前職 | 後職 |
| 01 | 安成季隆 | 1952年01月07日 - 1957年08月11日 | 陸士40期・ 砲工37期 | | 陸上幕僚監部施設課長 |
| 02 | 益田篤士 | 1957年08月12日 - 1961年07月31日 | 東京帝国大学 昭和6年卒 | 陸上幕僚監部施設課長 | 陸上幕僚監部付 →1962年01月01日 退職(陸将昇任) |
| 03 | 渡辺太郎 | 1961年08月01日 - 1963年07月31日 | 陸士43期・ 陸大50期 | 第7混成団副団長 兼 真駒内駐とん地司令 | 第1施設団長 兼 朝霞駐とん地司令 |
| 04 | 北崎昌安 | 1963年08月01日 - 1965年03月15日 | 陸士45期 | 陸上幕僚監部施設課長 | 第1施設団長 兼 朝霞駐とん地司令 |
| 05 | 青山左武郎 | 1965年03月16日 - 1966年07月15日 | 陸士45期・ 陸大56期 | 第4施設団長 兼 大久保駐とん地司令 | 陸上幕僚監部付 →1967年01月01日 退職(陸将昇任) |
| 06 | 吉武敏一 | 1966年07月16日 - 1969年07月15日 | 陸士49期・ 陸大59期 | 第2施設団長 兼 船岡駐とん地司令 | 陸上幕僚監部付 →1969年10月31日 退職(陸将昇任) |
| 07 | 千葉麿 | 1969年07月16日 - 1971年03月15日 | 陸士50期 | 第3施設団長 兼 南恵庭駐とん地司令 | 東北方面総監部付 →1971年06月30日 退職 |
| 08 | 山次惟貞 | 1971年03月16日 - 1972年03月15日 ※1972年01月01日 陸将昇任 | 陸士51期・ 陸大59期 | 陸上自衛隊幹部学校副校長 兼 企画室長 | 第3師団長 |
| 09 | 吉ケ江正 | 1972年03月16日 - 1974年03月15日 ※1973年04月01日 陸将昇任 | 東京帝国大学 昭和18年卒 | 自衛隊福岡地方連絡部長 | 第4師団長 |
| 10 | 藤井寛元 | 1974年03月16日 - 1976年03月15日 | 東京帝国大学 昭和19年卒 | 第2施設団長 兼 船岡駐とん地司令 | 技術研究本部技術開発官 (陸上担当) |
| 11 | 酒井次武 | 1976年03月16日 - 1977年06月30日 | 陸士56期 | 陸上幕僚監部施設課長 | 第1師団長 |
| 12 | 遠藤健 | 1977年07月01日 - 1978年07月27日 | 陸士57期 | 第1施設団長 兼 朝霞駐とん地司令 | 第1師団長 |
| 13 | 岩出俊男 | 1978年07月28日 - 1980年03月16日 ※1979年01月01日 陸将昇任 | 陸士58期 | 陸上自衛隊幹部学校教育部長 | 第2師団長 |
| 14 | 片岡博文 | 1980年03月17日 - 1982年03月15日 ※1980年07月01日 陸将昇任 | 海兵74期 | 第1施設団長 兼 朝霞駐屯地司令 | 退職 |
| 15 | 齊藤和治 (陸将) | 1982年03月16日 - 1984年03月15日 | 陸航士60期 | 第1施設団長 兼 朝霞駐屯地司令 |
| 16 | 三島正治 | 1984年03月16日 - 1986年03月15日 ※1984年05月01日 陸将昇任 | 関西学院大学 昭和30年卒 | 第1施設団長 兼 朝霞駐屯地司令 |
| 17 | 伊左次達 | 1986年03月16日 - 1989年06月29日 | 防大1期 | 陸上自衛隊調査学校長 | 陸上自衛隊幹部学校長 |
| 18 | 坂本滋 | 1989年06月30日 - 1990年07月08日 | 防大2期 | 第1施設団長 兼 朝霞駐屯地司令 | 退職 |
| 19 | 坂本良一 | 1990年07月09日 - 1993年03月23日 | 防大3期 | 第4師団副師団長 兼 福岡駐屯地司令 | 中部方面総監部付 →1993年04月01日 退職 |
| 20 | 岸良征 | 1993年03月24日 - 1995年03月22日 | 防大6期 | 第1施設団長 兼 朝霞駐屯地司令 | 第9師団長 |
| 21 | 若松重英 | 1995年03月23日 - 1997年06月30日 | 防大7期 | 第3施設団長 兼 南恵庭駐屯地司令 | 退職 |
| 22 | 園部宏明 | 1997年07月01日 - 1998年12月15日 | 防大8期 | 第4施設団長 兼 大久保駐屯地司令 |
| 23 | 太田実乗 | 1998年12月16日 - 2000年06月29日 | 防大10期 | 調達実施本部副本部長 (調達管理第二担当) |
| 24 | 野村昭嘉 | 2000年06月30日 - 2002年03月21日 | 防大11期 |
| 25 | 國分政夫 | 2002年03月22日 - 2003年06月30日 | 防大13期 | 第2施設団長 兼 船岡駐屯地司令 |
| 26 | 角南俊彦 | 2003年07月01日 - 2004年08月29日 | 防大19期 | 第4施設団長 兼 大久保駐屯地司令 | 陸上幕僚監部人事部長 |
| 27 | 出田孝二 | 2004年08月30日 - 2005年12月04日 | 防大15期 | 第3施設団長 兼 南恵庭駐屯地司令 | 退職 |
| 28 | 湖﨑隆 | 2005年12月05日 - 2008年07月31日 | 防大21期 | 第4施設団長 兼 大久保駐屯地司令 | 北部方面総監部幕僚長 兼 札幌駐屯地司令 |
| 29 | 小川祥一 | 2008年08月01日 - 2011年08月04日 | 防大21期 | 退職 |
| 30 | 赤松雅文 | 2011年08月05日 - 2013年08月21日 | 防大26期 | 第5施設団長 兼 小郡駐屯地司令 | 東北方面総監部幕僚長 兼 仙台駐屯地司令 |
| 31 | 富井稔 | 2013年08月22日 - 2014年12月18日 | 防大25期 | 退職 |
| 32 | 小瀬幹雄 | 2014年12月19日 - 2016年06月30日 | 東京大学 昭和61年卒[注 1] | 第1施設団長 兼 古河駐屯地司令 | 陸上自衛隊九州補給処長 兼 目達原駐屯地司令 |
| 33 | 中野義久 | 2016年07月01日 - 2017年07月31日 | 防大31期 | 自衛隊大阪地方協力本部長 | 東部方面総監部幕僚長 兼 朝霞駐屯地司令 |
| 34 | 腰塚浩貴 | 2017年08月01日 - 2019年08月22日 | 防大32期 | 第2施設団長 兼 船岡駐屯地司令 | 第9師団副師団長 兼 青森駐屯地司令 |
| 35 | 鵜居正行 | 2019年08月23日 - 2020年08月24日 | 防大31期 | 防衛装備庁プロジェクト管理部 プロジェクト管理総括官 | 防衛装備庁長官官房装備官 |
| 36 | 山﨑義浩 | 2020年08月25日 - 2022年12月22日 | 防大34期 | 陸上自衛隊開発実験団装備実験隊長 | 陸上自衛隊中央業務支援隊長 兼 市ヶ谷駐屯地司令 |
| 37 | 圓林栄喜 | 2022年12月23日 - 2025年12月15日 | 防大35期 | 第2施設団長 兼 船岡駐屯地司令 | 陸上自衛隊東北補給処長 |
| 38 | 𠮷春隆史 | 2025年12月16日 - | 防大38期 | 第4施設団長 兼 大久保駐屯地司令 | |